ऋषि यम ने नचिकेता को समझाया कि इंद्रियों को दृढ़ता से वश में रखना ही योग है। जब साधक अपने मन और इंद्रियों को पूरी तरह नियंत्रित कर लेता है, तभी वह सच्चे अर्थों में जागरूक होता है, क्योंकि यही योग का प्रारंभ और अंत है। यमराज आगे कहते हैं कि परमात्मा को न तो वाणी से, न मन से, और न ही आंखों से जाना जा सकता है। उसे वही जान सकता है जो पूरे विश्वास से कहता है—'वह है'। उसके अस्तित्व को स्वीकार करना ही उसकी प्राप्ति का मार्ग है। फिर वे बताते हैं कि परमात्मा को उसके दोनों स्वरूपों में, उसके वास्तविक स्वरूप में ही जानना चाहिए। जो उसे 'है' के रूप में जान लेता है, उसके लिए उसका सत्यस्वरूप प्रकट हो जाता है। जब हृदय में स्थित सभी इच्छाएं पूरी तरह समाप्त हो जाती हैं, तब यह नश्वर मनुष्य अमर हो जाता है और इसी जीवन में ब्रह्म की प्राप्ति कर लेता है। जब हृदय के सभी गांठें—संदेह, अज्ञान, और बंधन—टूट जाती हैं, तब मनुष्य अमरता को प्राप्त करता है। यही उपदेश का सार है। यमराज आगे कहते हैं कि हृदय से सौ एक नाड़ियाँ निकलती हैं, जिनमें से एक सिर के शीर्ष तक जाती है। जो साधक उस नाड़ी के मार्ग से ऊपर उठता है, वह अमरता को प्राप्त करता है। बाकी नाड़ियाँ विभिन्न दिशाओं में फैलती हैं और वे मृत्यु के मार्ग बन जाती हैं। फिर यमराज नचिकेता को बताते हैं कि हृदय में अंगूठे के आकार का आत्मा सदा स्थित रहता है। साधक को चाहिए कि वह सम्पूर्ण स्थिरता और धैर्य से, जैसे तिनके को उसके डंठल से निकालते हैं, वैसे ही आत्मा को अपने शरीर से अलग कर जाने। उसे पवित्र और अमर जानो—उसे पवित्र और अमर जानो। इस प्रकार, जब नचिकेता ने मृत्यु के द्वारा दी गई इस ज्ञान और योग की सम्पूर्ण विधि को प्राप्त कर लिया, तब वह ब्रह्म से एक हो गया—पापरहित, मृत्यु से मुक्त। जो भी इस आत्मा को इसी प्रकार जान लेता है, वह भी यही सिद्धि प्राप्त कर सकता है। अंत में, उपनिषद् एक मंगलकामना के साथ समाप्त होती है—'वह हम दोनों की रक्षा करे, हम दोनों का पालन-पोषण करे। हम दोनों मिलकर परिश्रम से कार्य करें। हमारा अध्ययन तेजस्वी और प्रकाशमय हो। हम एक-दूसरे से द्वेष न करें।