योगाच्या साधनेत जेव्हा साधक प्राणायामात पारंगत होतो, तेव्हा हा प्राणायाम त्याच्या सर्व दोषांना जाळून टाकतो आणि शरीराचे रक्षण करतो. जेव्हा श्वासोच्छ्वासावर खऱ्या अर्थाने प्रभुत्व मिळते, तेव्हा त्याची काही ठळक चिन्हे दिसू लागतात. मल, मूत्र आणि कफ यांचे प्रमाण कमी होते, शरीरात जास्त अन्न पचवण्याची क्षमता येते आणि दीर्घ काळ श्वास सोडता येतो. साधकाच्या अंगात हलकेपणा, वेग, उत्साह, मधुर वाणी, सर्व रोगांचा नाश, बळ, तेज आणि सौंदर्य प्रकट होते. त्याचप्रमाणे स्थैर्य, बुद्धिमत्ता, तरुणपण, मानसिक स्थिरता, स्पष्टता, तपस्येद्वारे पापांचा नाश, यज्ञ, दान आणि व्रतांचे पालन हे गुणही येतात. पण हे सर्व गुण मिळूनही प्राणायामाच्या सोळाव्या भागाइतकेही महत्त्वाचे नाहीत, जसे इंद्रिये विषयात गुंतली असता त्यांना मिळणारे सुख क्षुल्लक असते. जेव्हा साधक इंद्रियांना त्यांच्या विषयांपासून एकत्रितपणे परावृत्त करतो, तेव्हा त्याला प्रत्याहार असे म्हणतात. इंद्रिये त्यांच्या पूर्वीच्या कृतीनुसार साधकाला स्वर्गात किंवा नरकात घेऊन जातात. म्हणून, जो खरा सुखाचा इच्छुक आहे, ज्याच्याकडे विवेक आणि वैराग्य आहे, त्याने इंद्रियांवर नियंत्रण ठेवले पाहिजे. जसे घोड्यांना लगाम घालून थांबवतो, तसे इंद्रियांना आवरावे आणि स्वतःच स्वतःचा उद्धार करावा. संक्षेपाने, मन एका ठिकाणी स्थिर करणे म्हणजे धारणा होय. आणि ते ठिकाण म्हणजे केवळ शिव, दुसरे कोणीही नाही; कारण इतरत्र त्रिविध दोष उत्पन्न होतात. साधकाने मन शिवात स्थिर करावे आणि ठराविक काळासाठी तिथेच ठेवावे. जर मन त्या विषयापासून विचलित होत नाही, तर तीच खरी धारणा. धारणा केल्याने प्रथम मन स्थिर होते. म्हणून मनाला धारणा करून स्थिर करावे. ध्यानामध्ये आधार म्हणजे शिवाचे वारंवार स्मरण करणे. जेव्हा मन विचलित न होता एकाग्र होते आणि ध्यानाचा विषय जसा आहे तशीच जाणीव होते, तेव्हा ते ध्यान म्हणतात. इतर सर्व विचार सोडून, अविरतपणे एकाच प्रवाहात मन केंद्रित झाले की, ते ध्यान समजावे. सर्व सोडून, केवळ शिवच मंगलदायक आहे. सर्व देवांपेक्षाही श्रेष्ठ असा जो परमेश्वर, ज्याचा अथर्वण वेदांत उल्लेख आहे, तोच ध्यानाचा सर्वोच्च विषय. त्याचप्रमाणे, सर्वत्र व्यापलेली परमशिवा—शिव आणि शिवा—हे दोघेही सर्व प्राण्यांत व्यापलेले आहेत, यांचे ध्यान करावे. हे दोघेही, श्रुती आणि स्मृतींमध्ये सांगितल्याप्रमाणे, सर्वव्यापी, सर्वज्ञ आणि नेहमी ध्यान करण्याजोगे आहेत, जरी ते विविध रूपात प्रकट होत असले तरी. या ध्यानाचे दोन फळे सांगितली आहेत—एक म्हणजे मुक्ती, आणि दुसरे म्हणजे अणिमा वगैरे सिद्धींची प्राप्ती. ध्यान करताना साधकाने चार गोष्टी जाणून घ्याव्यात—ध्यान करणारा, ध्यान, ध्यानाचा विषय आणि ध्यानाचा हेतू. योग जाणणाऱ्याने या चार गोष्टींच्या ज्ञानासह योगाचा अभ्यास करावा. जो ज्ञान आणि वैराग्याने युक्त, श्रद्धावान, संयमी, अपरिग्रही आणि नेहमी उत्साही असतो, तोच खरा ध्यान करणारा समजावा. ज्या वेळी जप करून थकलात, तेव्हा पुन्हा ध्यान करा; आणि ध्यान करून थकलात, तर पुन्हा जप करा. जप आणि ध्यान या दोन्हीचा अभ्यास करणाऱ्याला योग लवकरच सिद्ध होतो. एकाग्रता म्हणजे बारा श्वासांची कालमर्यादा; ध्यान हे एकाग्रतेच्या बारा पट आहे. जेव्हा ध्यान बारा पट होते, तेव्हा त्यास समाधी म्हणतात. समाधी हा योगाचा अंतिम अंग आहे. समाधीमुळे ज्ञानाचा प्रकाश सर्वत्र पसरतो. ज्या अवस्थेत ध्यानाचा विषयच शिल्लक राहतो, आणि मनाचे अस्तित्व जणू विरघळून जाते, तीच समाधी होय. मन ध्यानाच्या विषयात पूर्णपणे विलीन होते आणि साधक त्या विषयाला ठामपणे जाणतो. जो योगी समाधीत स्थिर आहे, त्याची तुलना मुक्तीच्या अग्निशी केली जाते. समाधीत असताना तो न ऐकतो, न वास घेतो, न बोलतो, न पाहतो, न स्पर्श जाणतो, न मनात काही विचार करतो. तो काहीही विचार करत नाही, न बांधला जातो, फक्त एका लाकडाच्या ओंडक्यासारखा राहतो. जेव्हा आत्मा शिवात विलीन होतो, तेव्हा तो समाधिस्थ योगी असे वर्णन केले जाते. जसे वाऱ्याविना ठेवलेल्या दिव्याची ज्योत हलत नाही, तसे समाधीत स्थिर झालेला ज्ञानी डळमळत नाही. असा योगाभ्यास करणाऱ्या साधकाचे सर्व विघ्न हळूहळू नाहीसे होतात आणि तो श्रेष्ठ योग प्राप्त करतो. योगाभ्यासात दहा अडथळे सांगितले आहेत—आळस, तीव्र रोग, असावधानी, योग्य स्थानाबद्दल शंका, चंचल मन, श्रद्धेचा अभाव, भ्रम, दुःख, खिन्नता आणि विषयांबद्दल अस्वस्थता. आळस म्हणजे शरीर व मनाची जडता; रोग म्हणजे शरीरातील दोषांमुळे उत्पन्न होणारे विकार; आणि दोष म्हणजे चुकीच्या कृतीमुळे निर्माण होणारे परिणाम. असावधानी म्हणजे योगातील विस्मरण; तर साधना म्हणजे ध्यान. दोन्हीच्या संयोगाने निर्माण झालेले ज्ञान म्हणजे स्थानाविषयी शंका. मनाची चंचलता म्हणजे स्थैर्याचा अभाव; श्रद्धेचा अभाव म्हणजे योगमार्गात निश्चय नसणे. जे ज्ञान चुकीचे आहे, त्याला भ्रम म्हणतात. अज्ञानामुळे निर्माण झालेले दुःख हे अंतःकरणातील क्लेश आहे. शरीरातील क्लेश म्हणजे पूर्वीच्या कर्मामुळे किंवा शारीरिक कारणांमुळे होणारे दुःख; ग्रह, विष इत्यादींमुळे होणारे दैविक क्लेशही सांगितले आहेत. मोक्षाची इच्छा बाधित झाल्यामुळे निर्माण झालेली खिन्नता, आणि विषयांच्या विविधतेमुळे निर्माण झालेली अस्थिरता—हे अडथळे आहेत. जेव्हा हे अडथळे शांत होतात, तेव्हा योगाभ्यासात रत असलेल्या साधकात दैवी लक्षणे प्रकट होतात. हीच सिद्धीची चिन्हे आहेत. पण दृष्टी, श्रवण, वार्ता, दर्शन, स्वाद आणि स्पर्श—ही सहा योगात अडथळे आहेत; त्यांचा लोप झाला की योगाची सिद्धी होते. दृष्टी म्हणजे सूक्ष्म, गुप्त, भूतकाळातील, दूरस्थ किंवा भविष्यकाळातील वस्तूंचे जसेच्या तसे ज्ञान मिळणे. श्रवण म्हणजे सर्व ध्वनी सहज ऐकू येणे; वार्ता म्हणजे सर्व जीवांमधील माहिती सहज समजणे. दर्शन म्हणजे दैवी वस्तू सहज पाहणे; आणि स्वाद म्हणजे दिव्य स्वादांचा अनुभव घेणे. अशा प्रकारे, योगसाधनेच्या या मार्गावर साधक प्रगती करत जातो, अडथळे पार करतो, आणि अखेरीस शिवस्वरूपाशी एकरूप होतो.