आग्निकुण्ड की स्थापना के लिए शास्त्रों में जिस विधि का वर्णन है, वह अत्यंत विशिष्ट और पवित्र है। सर्वप्रथम, अग्निकुण्ड को चौड़ा और गहरा बनाना चाहिए, जिसके मध्य में आठ पंखुड़ियों वाला कमल हो। यह कमल भूमि से चार अंगुल ऊँचा हो सकता है, या आवश्यकता अनुसार दो अंगुल भी पर्याप्त है। अग्निकुण्ड की ऊँचाई एक विटस्ति (हथेली के फैलाव) की दुगुनी होती है, परंतु वह नाभि से अधिक नहीं होनी चाहिए। बीच का भाग मध्यमा अंगुली के मध्य और ऊपरी पोर के बीच की नाप से निर्धारित होता है। ज्ञानी जनों के अनुसार, एक हाथ की माप चौबीस अंगुल होती है। अग्निकुण्ड के चारों ओर तीन, दो या एक मेखला (पट्टी) बनाई जा सकती है। कुण्ड को मिट्टी से सुंदर, चिकना और दृढ़ बनाना चाहिए, उसका आकार अंजीर के पत्ते या हाथी के आधार जैसा होना चाहिए। मेखला को मध्य में, पश्चिम या दक्षिण दिशा में, अग्नि से थोड़ी नीची और हल्के खुले मुख वाली बनाना चाहिए। मेखला का मुंह अग्निकुण्ड की ओर थोड़ा खुला छोड़ना चाहिए। वेदी की ऊँचाई के लिए कोई निश्चित नियम नहीं है, चाहे वह कोमल हो या रेतीली। कुण्ड के चारों ओर गोबर और जल से वृत्त बनाना चाहिए। पात्र की माप का कोई विशेष विधान नहीं है, परंतु अग्निकुण्ड मिट्टी का होना चाहिए और वेदी को गोबर तथा जल से लीपना चाहिए। पात्र को धोकर, उसे अग्नि में गर्म करें और फिर अन्य जल से छिड़काव करें। अपनी परंपरा के अनुसार, अग्निकुण्ड आदि पर चिह्न अंकित करें। फिर, उस स्थान को छिड़ककर, अग्नि के आसन के लिए कुश या पुष्प बिछाएँ और पूजन तथा होम के लिए सभी सामग्री एकत्र करें। जो भी वस्तुएँ धोने योग्य हैं, उन्हें धोकर छिड़क कर शुद्ध करें—चाहे वे रत्न, काष्ठ या किसी विद्वान ब्राह्मण के घर से लाई गई हों। यदि उपयुक्त अग्नि उपलब्ध हो, तो उसे आदरपूर्वक लाएँ, अग्निकुण्ड के चारों ओर तीन बार घुमाएँ। अग्नि के बीजमंत्र का उच्चारण करते हुए, अग्नि को आसन पर स्थापित करें—यह स्थापना योनिपथ से या अपने मुख की ओर देखकर भी की जा सकती है। कुशल साधक को सम्पूर्ण अग्निकुण्ड की व्यवस्था करते हुए अग्नि को ऐसे स्थापित करना चाहिए, मानो वह उसकी अपनी नाभि से उत्पन्न होकर बाहर निकल रही हो। अग्नि के प्रकट होने के बाद, उस बाह्य अग्नि को चक्र रूप में एकीकृत रूप में ध्यान करें, और घृत-शुद्धि की पूर्णता तक पूर्वकृत संस्कारों का पालन करें। अपनी परंपरा के अनुसार, मन्त्रज्ञ को मूलमंत्र से शिवस्वरूप की पूजा कर दक्षिण दिशा से आगे बढ़ना चाहिए। घृत में मन्त्र स्थापित कर, 'गाय' नामक मुद्रा दिखाएँ और स्वर्ण निर्मित चमचे लें—ये न तो कांस्य, न लोहा, न पत्थर के हों। आवश्यकता अनुसार, यज्ञीय लकड़ी के, या शास्त्रसम्मत शिल्प से बने, या किसी पवित्र वृक्ष की पत्ती के, जो बीच से उठी और अखंड हो—ऐसे चमचे भी मान्य हैं। चमचों को कुश से जोड़कर अग्नि में तपाएँ और पुनः छिड़काव करें, प्रारंभ में शिव के संस्कार से आरंभ कर परंपरानुसार आगे बढ़ें। अग्निशुद्धि के लिए आठ बीजमंत्रों—'भ्रुं', 'स्तुं', 'ब्रुश्रुं', 'पुंड्रं', 'द्रं' आदि—से आहुति दें। अग्नि की सात जिह्वाओं के लिए सात बीजमंत्र क्रमशः हैं, जिनमें मध्य की 'त्रिशिखा' कहलाती है, जो अनेक रूपों में जानी जाती है। अग्नि की जिह्वाएँ हैं—रक्ता (लाल), आग्नेयी, नैऋती, कृष्णा (काली), सुप्रभा, मरुत्जिह्वा आदि—जिनका तेज उनके नाम के अनुरूप है। प्रत्येक बीजमंत्र के बाद 'स्वाहा' का उच्चारण करें और घृत की आहुति उन जिह्वाओं को क्रमशः अर्पित करें। फिर मध्य में 'रं', 'वह्नये', 'स्वाहा' से तीन आहुति दें और घृत या पवित्र लकड़ी से छिड़काव करें। इस प्रकार करने पर शिव की अग्नि प्रतिष्ठित हो जाती है। वहाँ शिव के आसन का ध्यान करें, देवता का आह्वान कर अर्धनारीश्वर शिव की पूजा करें, दीप तक छिड़काव करें और उत्तम प्रकार से हवन करें। हवन के लिए पलाश या अन्य उपयुक्त वृक्ष की लकड़ी लें, जो बारह अंगुल लंबी, सीधी, स्वाभाविक रूप से सूखी न हो, छाल युक्त, दोषरहित और समरूप हो। चाहें तो दस अंगुल लंबी या हथेली जितनी लंबी लकड़ी भी ले सकते हैं, सभी को अग्नि में अर्पित करें। इसके बाद, दूर्वा घास की पत्ती के समान, चार अंगुल लंबी घृत की आहुति दें और फिर एक अन्न के दाने के बराबर भोजन अर्पित करें। इसी प्रकार, उपलब्ध होने पर लाई, सरसों, जौ, तिल, तथा खाने, चाटने या चूसने योग्य पदार्थ, सब घृत में मिलाकर अर्पित करें। वहाँ दस, पाँच या तीन आहुति दें—या सामर्थ्यानुसार केवल एक भी पर्याप्त है। घृत को चमचे से, या उसके अभाव में हाथ से, दिव्य या शास्त्रविहित पात्र से, अथवा ऋषि द्वारा पवित्र किए जल से अर्पित करें। यदि एक ही पदार्थ उपलब्ध हो, तो श्रद्धा से उसे अर्पित करें; प्रायश्चित्त हेतु तीन बार पुनः मंत्र के साथ आहुति दें। फिर, विशेष रूप से तैयार घृत से चमचा भरकर, उसके अग्रभाग पर पुष्प रखें और नीचे की ओर पकड़े रहें। उस पर कुश घास से ढँक दें, जड़ वाला भाग जोड़कर दोनों हथेलियों में ऊँचा रखें और जौ के डंठल जितनी मोटी धारा में 'वौषट्' उच्चारण के साथ आहुति दें। पूर्ण आहुति देने के बाद, पूर्ववत् जल छिड़कें; फिर भगवान का विसर्जन कर, अग्नि की रक्षा करें। उस अग्नि का भी विसर्जन कर, नाभि में पूजा करें और सामग्री प्रतिदिन यथावत् रखें; या अग्नि लाकर शिवशास्त्र के अनुसार आगे बढ़ें। वाणी और मन की योनि से उत्पन्न अग्नि को विधिपूर्वक तैयार कर फिर से ईंधन और वेदिकाबंध की व्यवस्था करें। पात्रों को जोड़े में रखकर शिव की पूजा करें, छिड़काव पात्र को शुद्ध कर, उन पर जल छिड़कें। जल लाने का पात्र पूर्वोत्तर में रखें, उसमें जल भरें और घृत के अभिषेक तक के संस्कार करें, फिर माला और चमचे को शुद्ध करें। इसके बाद, गर्भाधान, पुंसवन और सीमन्तोन्नयन संस्कार करें और उन्हें पृथक-पृथक अर्पित करें; फिर नवसंचालित अग्नि का ध्यान करें। उस अग्नि का ध्यान इस प्रकार करें—वह तीन चरणों वाली, सात भुजाओं वाली, चार सींगों वाली, दो सिरों वाली, मधु-रंग की, तीन नेत्रों वाली, जटाजूटधारी और सिर पर अर्धचंद्र धारण किए हुए है। इस प्रकार, शास्त्रों में वर्णित विधि से अग्निकुण्ड और हवन की सम्पूर्ण व्यवस्था पूर्ण होती है, जिसमें श्रद्धा, शुद्धता और विधिपूर्वक प्रत्येक क्रिया का पालन अनिवार्य है।