जब शिव पूजा का विधान आरंभ होता है, तब यज्ञकर्ता पहले विधि अनुसार हवन करता है और फिर पूजा की शेष प्रक्रियाएँ पूर्ण करता है। विधिवत सभी अनुष्ठान सम्पन्न कर लेने के बाद, निर्देशित मंत्रों का जप करता है। इसके बाद, शिव के आदेशानुसार, प्रतिदिन का उत्सव बड़े, दीप्तिमान पात्र में, जो लाल कमलों से सुसज्जित हो, सम्पन्न किया जाता है। इस उत्सव में, दिव्य पाशुपतास्त्र का आह्वान और पूजा की जाती है। शिव का पात्र एक सज्जित ब्राह्मण के ऊपर रखा जाता है। उस ब्राह्मण पर अस्त्र का स्वरूप स्थापित किया जाता है, वह चमकदार दंड हाथ में लेकर, मंदिर के बाहर शुभ ध्वनियों के साथ खड़ा होता है। नृत्य, गीत, दीप, ध्वज आदि के साथ तीन बार वेदी की परिक्रमा की जाती है—न बहुत तेज़, न बहुत धीमी। तीन बार परिक्रमा के बाद, यज्ञकर्ता द्वार पर हाथ जोड़कर खड़ा होता है, फिर भीतर जाकर अस्त्र को मंदिर में ले जाता है और उसका विसर्जन करता है। इसके पश्चात, पूर्ववर्णित विधि से परिक्रमा और अन्य कृत्य पूर्ण कर, आठ पुष्प लेकर पूजा सम्पन्न करता है। अब अग्नि-विधान का विस्तार बताया जाता है—चाहे वह अग्नि गड्ढे में हो, भूमि पर, वेदी पर, या लोहे अथवा शुभ मिट्टी के पात्र में हो। अग्नि को विधि अनुसार स्थापित कर, उसे ठीक से तैयार किया जाता है, फिर वहीं महादेव की पूजा और हवन किया जाता है। अग्निकुंड दो हथेलियों या एक हथेली चौड़ा बनाया जा सकता है, गोल या चौकोर रूप में; साथ ही एक मंडल वेदी भी बनाई जाती है। अग्निकुंड चौड़ा और गहरा हो, उसके मध्य में आठ पंखुड़ियों वाला कमल बना हो, वह चार अंगुल या दो अंगुल ऊँचा उठाया गया हो। उसकी ऊँचाई दो स्पान हो, नाभि से अधिक न हो; केंद्र मध्य अंगुल से मापा जाता है, उसके मध्य और ऊपरी जोड़ के बीच। विद्वानों के अनुसार, एक हाथ में चौबीस अंगुल होते हैं; कुंड के चारों ओर तीन, दो या एक मेखला (बेल्ट) बनाई जाती है। अग्निकुंड को सुंदर, चिकना और दृढ़ मिट्टी से बनाना चाहिए, वह अंजीर के पत्ते या हाथी के आधार जैसा हो। मेखला मध्य में, पश्चिम या दक्षिण में बनाई जाती है, वह अग्नि से थोड़ी नीची और सुंदर हो, उसमें हल्का सा खुला द्वार हो। मेखला को अग्निकुंड की ओर थोड़ा खुला छोड़ना चाहिए; वेदी की ऊँचाई के लिए कोई निश्चित नियम नहीं है, चाहे वह नरम हो या रेतीली। मंडल गोबर और जल से बनाया जाता है; पात्र का माप निश्चित नहीं है। अग्निकुंड मिट्टी का हो, वेदी गोबर और जल से लीपी जाए। पात्र को धोकर, गर्म किया जाता है और फिर अन्य जल से छिड़का जाता है। अपनी परंपरा के अनुसार, अग्निकुंड आदि पर चिन्ह अंकित किए जाते हैं। छिड़काव के बाद, अग्नि के आसन के लिए कुश या फूल बिछाए जाते हैं, पूजा और हवन के सभी सामग्री तैयार की जाती हैं। धोने योग्य वस्तुएँ, चाहे रत्न की हों, लकड़ी की हों, या किसी विद्वान ब्राह्मण के घर से आई हों, उन्हें भी छिड़काव से शुद्ध किया जाता है। यदि कोई अन्य योग्य अग्नि लाई जाए, तो उसे सम्मानपूर्वक लाया जाता है, अग्निकुंड आदि के चारों ओर विधिवत तीन बार परिक्रमा की जाती है। अग्नि के बीज मंत्र का जप करते हुए, अग्नि को आसन पर रखा जाता है, चाहे योनि मार्ग से या स्वयं के सामने। कुशल व्यक्ति अग्निकुंड की पूरी व्यवस्था करता है, अग्नि को ऐसे स्थापित करता है जैसे वह उसकी नाभि से उत्पन्न होकर चिंगारी की भाँति निकली हो। अग्नि प्रकट होने के बाद, बाह्य अग्नि को चक्र रूप में ध्यान किया जाता है, घृत शुद्धि तक पूर्वकृत्य के अनुसार। अपनी परंपरा के क्रम में, मंत्रज्ञ व्यक्ति मूल मंत्र से शिव का स्वरूप पूजन कर, दक्षिण दिशा से अग्नि-विधान आरंभ करता है। मंत्र को घृत पर स्थापित कर, 'गाय' नामक मुद्रा दिखाता है और स्वर्ण निर्मित स्रुवा (चम्मच) उठाता है; कांस्य, लोहा या पत्थर के स्रुवा वर्जित हैं। या यज्ञीय लकड़ी से, या शिल्पानुसार, या किसी पवित्र वृक्ष की पत्ती से, जो बीच से उठी और अखंड हो, स्रुवा बन सकता है। दर्भा से स्रुवा जोड़कर, अग्नि में गर्म किया जाता है और फिर छिड़काव किया जाता है, अपनी परंपरा के अनुसार, शिव की पूजा से आरंभ कर। अग्नि शुद्धि के लिए आठ बीज मंत्रों से हविष (अर्पण) किया जाता है—'भ्रुं', 'स्तुं', 'ब्रुश्रुं', 'पुंड्रं', 'ड्रम' आदि। सात बीज मंत्र सात अग्नि जिह्वाओं के लिए क्रमशः हैं; मध्य जिह्वा 'त्रिशिखा' कहलाती है, जो अनेक रूपों वाली है। जिह्वाएँ—रक्ता (लाल), आग्नेयी (तेजस्विनी), नैरृति (निरृति की), कृष्णा (काली), सुप्रभा (सुंदर), मरुत्जिह्वा (पवन की जिह्वा)—अपने नामानुसार चमकती हैं। प्रत्येक बीज मंत्र के बाद 'स्वाहा' का उच्चारण होता है; उन जिह्वा मंत्रों से घृत अर्पित कर, प्रत्येक जिह्वा को क्रमशः अर्पण किया जाता है। मध्य में 'रं', 'वह्नये', 'स्वाहा' से तीन आहुति देकर, घृत या यज्ञीय लकड़ी से छिड़काव किया जाता है। जब यह सम्पन्न हो जाता है, तब शिव की अग्नि स्थापित होती है; वहीं शिव के आसन का ध्यान किया जाता है। उस स्थान पर देवता का आह्वान कर, अर्धनारीश्वर शिव की पूजा की जाती है, दीप तक छिड़काव कर, उत्तम प्रकार का हवन किया जाता है। हवन के लिए पलाश या अन्य योग्य वृक्ष की लकड़ी, बारह अंगुल लंबी, सीधी, अखंड छाल वाली, दोष रहित, समान आकार की चुनी जाती है। वैकल्पिक रूप से वे दस अंगुल लंबी, छोटी अंगुल से मापी, या हथेली के आकार की हो सकती है; सभी को अग्नि में अर्पित किया जाता है। इसके बाद, दूर्वा घास के ब्लेड के आकार की, चार अंगुल लंबी घृत की आहुति दी जाती है, फिर एक दाने के बराबर भोजन अर्पित किया जाता है। इसी प्रकार, यदि उपलब्ध हो, फूला हुआ चावल, सरसों, जौ, तिल, तथा खाने, चाटने या चूसने योग्य पदार्थ, सब घृत में मिलाकर अर्पित किए जाते हैं। यहाँ दस, पाँच या तीन आहुति दी जाती हैं, या अपनी क्षमता अनुसार एक ही आहुति भी दी जा सकती है। घृत स्रुवा से अर्पित किया जाता है, या स्रुवा न हो तो हाथ से, दिव्य या विधि अनुसार पात्र से, या किसी ऋषि द्वारा पवित्र किए जल से भी अर्पण किया जा सकता है। इस प्रकार, शिव पूजा और अग्नि-विधान की पूरी प्रक्रिया श्रद्धापूर्वक सम्पन्न होती है।