एक भक्त जब भगवान शिव की पूजा के लिए मंदिर में प्रवेश करता है, तो सबसे पहले वह भीतर के कक्ष के स्वामी, नंदी का विधिपूर्वक पूजन करता है। नंदी, जो समस्त आभूषणों से विभूषित हैं और स्वर्ण पर्वत के समान दीप्तिमान दिखाई देते हैं, अत्यंत सौम्य हैं। उनके सिर पर अर्धचंद्र का मुकुट है, उनके तीन नेत्र और चार भुजाएँ हैं, जिनमें वे चमकता हुआ त्रिशूल, मृग, तीक्ष्ण दंड और अन्य आयुध धारण किए हुए हैं। वे सबके स्वामी हैं। उनका मुख चंद्रमा के समान या हरि के मुख की तरह मनोहर है। मंदिर के प्रवेश द्वार के उत्तरी भाग में, भक्त को उनकी पत्नी, पवनकन्या का पूजन करना चाहिए। फिर माता सुयशा का पूजन करें, जो धर्मपरायण, व्रत में निष्ठावान और भगवान के चरणों को सजाने में तत्पर रहती हैं। इन सबका पूजन कर भक्त परमेश्वर के अंतरालय में प्रवेश करता है। अब भक्त लिंग का पूजन उन समस्त सामग्रियों से करता है, फिर पूजन में प्रयुक्त वस्तुएँ हटाकर लिंग को धोता है और उसकी शुद्धि के लिए उसके शीश पर पुष्प अर्पित करता है। पुष्प को हाथ में लेकर, मंत्र की शुद्धि के लिए बलपूर्वक उसका जप करता है। फिर उत्तर-पूर्व दिशा में चंड का पूजन कर, बची हुई पूजन सामग्री हटवा देता है। इसके पश्चात, आसन और उसके सहायक उपकरणों को यथाक्रम व्यवस्थित करता है। पृथ्वी के नीचे शुभ, श्यामवर्णी आधार-शक्ति का ध्यान करता है। उसके आगे, अंतहीन, सर्पाकार, श्वेत, पाँच फनों वाले, आकाश को चाटते हुए प्रतीत होने वाले रूप का ध्यान करता है। उसके ऊपर शुभ, चार पायों वाले, चौकी जैसे आसन का ध्यान किया जाता है, जिसके चार आधार धर्म, ज्ञान, वैराग्य और ऐश्वर्य हैं। ये आधार क्रमशः श्वेत, लाल, पीले और श्याम वर्ण के हैं, जो दक्षिण-पूर्व से चारों दिशाओं में स्थित हैं। अधर्म आदि को पूर्व से उत्तर की ओर क्रम से रखते हैं। इन आधारों के अंगों को राजसी रत्नों के समान कल्पना करें, और इन सबसे ऊपर शुद्ध श्वेत कमल का आसन है, जो आवरण का कार्य करता है। इस कमल की आठ पंखुड़ियाँ हैं, जो अणिमा आदि आठ सिद्धियों का प्रतीक हैं। बाएँ से शुरू होने वाले रेशे रुद्र और बाईं ओर की शक्तियाँ हैं। बीज भी वही शक्तियाँ हैं, जो भीतर उन्मनी तक स्थित हैं। भीतर का पात्र सर्वोच्च वैराग्य है, डंठल ज्ञान रूप है, जो शिवस्वरूप है। भीतर के पात्र के अंत में कंद है, जो शिव और धर्म स्वरूप है, और उसमें तीन मंडलियाँ हैं। इन तीन मंडलियों के ऊपर आत्मा आदि तीन तत्वों का आसन है। इन सब आसनों के ऊपर, विविध वस्त्रों से आच्छादित, दिव्य और शुद्ध ज्ञान से दीप्तिमान, सुखद आसन बिछाना चाहिए। फिर आवाहन, स्थापना, सीमांकन, निरीक्षण तथा प्रणाम आदि क्रियाएँ अलग-अलग हस्तमुद्राओं से करनी चाहिए। इसके बाद भक्त को पाद्य, आचमनीय, अर्घ्य, गंध, पुष्प, धूप, दीप और ताम्बूल अर्पित करना चाहिए, और फिर भगवान शिव को विश्राम देना चाहिए। या फिर, आसन और प्रतिमा को जड़ और अन्य ब्रह्मा मंत्रों से पूर्ण कर, शिव का आवाहन करें, जो परम कारण, देवी के साथ, अचल, अविनाशी और शुद्ध स्फटिक के समान दीप्तिमान हैं। वे समस्त लोकों के कारण, परम तत्व और समस्त जगत के सारस्वरूप हैं। वे भक्तों को सहज ही सुलभ हैं, अविनाशी भगवान हैं, परंतु ब्रह्मा, इन्द्र, विष्णु, रुद्र जैसे देवताओं की पहुँच से परे हैं। ज्ञानी पुरुष उन्हें देवताओं के भी सारस्वरूप जानते हैं, फिर भी वे इंद्रियगोचर नहीं हैं; वे न आदि हैं, न मध्य, न अंत, और संसार से पीड़ितों के लिए परम औषधि हैं। यही शिवतत्त्व है, जो संसार में शिव का स्थायी उद्देश्य है। भक्त को परम लिंग का पंचोपचार और भक्ति के साथ पूजन करना चाहिए। लिंग स्वयं महेश्वर शिव का रूप है, जो परमात्मा हैं। जब अभिषेक का समय हो, तो विजयध्वनि से शुभारंभ करें। गाय के पंचगव्य—घी, दूध, दही, मधु आदि—के साथ, जड़ों, फलों के सार, तिल, सरसों, आटे की विविध वस्तुओं से अभिषेक करें। जौ जैसे उत्तम बीजों, उड़द आदि की धूल से बनी लेप से लिंग का स्नान और अभ्यंग करें, फिर गुनगुने जल से स्नान कराएँ। बिल्वपत्र आदि से रगड़कर लेप और गंध का अवशेष हटाएँ, फिर पुनः जल से स्नान कर, राजाओं के विधि अनुसार आगे बढ़ें। सुगंधित आँवला और हल्दी यथाक्रम अर्पित करें, फिर लिंग या प्रतिमा को जल से शुद्ध करें। सुगंधित जल, कुशा और पुष्पयुक्त जल, सुवर्ण और रत्नों से युक्त, मंत्रों से अभिमंत्रित जल से क्रमशः स्नान कराएँ। यदि ये वस्तुएँ उपलब्ध न हों, तो जो भी उपलब्ध हो, या केवल मंत्र-संयुक्त जल से भी श्रद्धा सहित शिव का अभिषेक करें। फिर कलश, शंख, वृद्धि पात्र, हाथ, कुशा और पुष्पों से, मंत्रजप करते हुए स्नान कराएँ। पवमाना, रुद्र, नीला, त्वरिता, लिंगसूक्त, अथर्वशीर्ष आदि स्तोत्रों से, ऋग्वेद, सामवेद, पाँच शैव ब्राह्मण स्तोत्रों और शिव प्रणव से भगवान का स्नान करें। जैसे भगवान का अभिषेक और अन्य पूजन करते हैं, वैसे ही देवी का भी करें, उनमें कोई भेद नहीं है। पहले भगवान का अभिषेक आदि करें, फिर देवी का, जैसा भगवान ने आदेश दिया है। अर्धनारीश्वर की पूजा में दोनों में कोई प्राथमिकता नहीं है; उस स्थिति में लिंग या अन्य उपयुक्त स्थान पर अर्पण करें। शुद्ध और सुगंधित द्रव्यों से लिंग का अभिषेक कर, उसे वस्त्र से पोंछें, वस्त्र और यज्ञोपवीत अर्पित करें। फिर पाद्य, आचमनीय, अर्घ्य, गंध, पुष्प, आभूषण, धूप, दीप, नैवेद्य, पीने का जल और मुखशुद्धि अर्पित करें। पुनः आचमनीय जल और मुखविलास दें, फिर सुंदर, शुभ, विविध रत्नों से सुसज्जित मुकुट अर्पित करें। शुद्ध आभूषण, रंग-बिरंगी मालाएँ, पंखे, चामर, छत्र, ताड़पत्र का पंखा और दर्पण भी भगवान को अर्पित करें। इस प्रकार श्रद्धा और विधिपूर्वक भगवान शिव का पूजन संपन्न होता है।