आचार्य को चाहिए कि वह जिन तत्वों से इन्द्रियाँ, शरीर और विषय उत्पन्न होते हैं—उनका मूल, अर्थात् शान्त्यतीता से आरम्भ होने वाली कलाओं को, जो आकाश आदि पंचमहाभूतों के रूप में हैं, ध्यानपूर्वक देखे। फिर उन कलाओं को उनके अपने-अपने नामों से सूत्र में पिरोकर, नमस्कारपूर्वक उनकी पूजा करे, अथवा उन्हें बीज-रूप बनाकर, पूर्ववर्णित विधि के अनुसार आगे बढ़े। इसके बाद, मल (अशुद्धि) और तत्वों से आरम्भ कर, कलाओं की व्यापकता का अवलोकन करे; मल आदि की आहुति अर्पित कर, उन कलाओं को जागृत करे। फिर शिष्य के सिर पर हल्का प्रहार करते हुए, क्रम से उसके शरीर पर सूत्र का चिह्न अंकित करे; शान्त्यतीता अवस्था में मन्त्र का उच्चारण करते हुए सूत्र अंकित करे। इस प्रकार, निवृत्ति और शान्त्यतीता तक की सारी क्रियाएँ क्रमशः पूर्ण कर, तीन आहुति अर्पित कर, शिव की मण्डल में पूजा करे। फिर शिष्य को देवता के दाहिने भाग में उत्तराभिमुख बैठाकर, मण्डल में कुशासन पर चारु (हवन का शेष अन्न) अर्पित करे। शिष्य श्रद्धापूर्वक गुरु द्वारा दिया गया चारु, शिव को साक्षी मानकर, ग्रहण करे, फिर दो बार मुख प्रक्षालन कर, शिव मन्त्र का जप करे। फिर, दूसरे मण्डल में, आचार्य शिष्य को पंचगव्य (गाय के पाँच पवित्र द्रव्य) दे, जिसे शिष्य अपनी शक्ति अनुसार पीकर दो बार मुख प्रक्षालन करे और शिव का स्मरण करे। तीसरे मण्डल में, पूर्ववत् शिष्य को बैठाकर, शास्त्रानुसार दन्तधावन (दातुन) दे। शिष्य को चाहिए कि वह कोमल अग्रभाग वाली दातुन लेकर, पूर्व या उत्तरमुख बैठ, मौन रहकर दाँत साफ करे। दन्तधावन और मुख प्रक्षालन के बाद, शिव का स्मरण कर, गुरु के निर्देशानुसार, हाथ जोड़कर, शिव मण्डल में प्रवेश करे। यदि दातुन का त्याग किया हुआ भाग पूर्व, उत्तर या पश्चिम दिशा में दिखाई दे, तो गुरु को चाहिए कि उसका शेष भाग शिव या अन्य देवता को अर्पित करे। यदि दातुन अशुभ दिशा में हो, तो गुरु को दोष निवारणार्थ मूल मन्त्र से सौ, पचास या उसका आधा भाग आहुति देनी चाहिए। फिर गुरु शिष्य को गले लगाकर, शिव मन्त्र दोनों कानों में उच्चारित करे और शिष्य को देवता के दाहिने भाग में बैठाए। रात में, स्वच्छ और नूतन कुशासन पर, शिरः पूर्वाभिमुख रखकर, शुद्धता के साथ, शिव का आन्तरिक ध्यान करते हुए, शयन करे। गुरु शिष्य की जटा में सूत्र बाँधकर, उसके अपने बालों से उसे दृढ़ करे, और नूतन वस्त्र तथा रक्षात्मक वस्त्रों से उसे ढँके। शय्या के चारों ओर भस्म, तिल और सरसों से तीन रेखाएँ खींचे; रक्षामन्त्रों का जप कर, दिशाओं के रक्षकों को बाहर आहुति दे। शिष्य भी समीप ही उपवासपूर्वक, विधिपूर्वक तैयारी कर, जागरण के बाद, स्वप्न गुरु को निवेदित करे। फिर, गुरु के निर्देशानुसार, सभी स्नान और सम्बन्धित कृत्य पूर्ण कर, हाथ जोड़कर, शिव मण्डल के समीप पहुँच, शिव का ध्यान करे। अगले दिन, पूजन छोड़कर, पूर्ववत् सभी क्रियाएँ—आँखों पर पट्टी बाँधने तक—कर, गुरु मण्डल को प्रकट करे। शिष्य, नेत्रबन्धन के साथ, जहाँ फूल बिखेरे, वहाँ गुरु उस स्थान से सम्बद्ध नाम बताए। फिर, त्यागे हुए अर्पणों को मण्डल में लाकर, पूर्ववत् ईशान भगवान् की पूजा करे और शिव के अग्नि में आहुति दे। यदि शिष्य ने स्वप्न में कोई अशुभ चिन्ह देखा हो, तो उसके दोष निवारण के लिए मूल मन्त्र से सौ, पचास या उसका आधा भाग आहुति दे। तदनन्तर, पूर्ववत्, जटाओं में बँधा सूत्र नीचे छोड़ दे; और प्रतिष्ठा-पूजन से निवृत्ति की अवस्थाओं के अनुसार आगे बढ़े। वागीश्वरी की पूजा पूर्ण करे, आहुति अर्पित कर, वागीश को नमस्कार करे, जो निवृत्ति का सर्वव्यापक कारण है, फिर आगे बढ़े। मण्डल में देवता की पूजा कर, तीन आहुति देकर, सभी योनियों में एकसाथ बालकत्व की प्राप्ति का अनुदान करे। फिर शिष्य के लिए, सूत्र-शरीर पर प्रहार, छिड़काव आदि विधियाँ सम्पन्न करे; स्वयं ग्रहण कर, बारहवें खण्ड में निवेदन करे। इसके बाद, शास्त्रानुसार मुद्राओं से मूल को ग्रहण कर, गुरु को चाहिए कि वह शिष्य का एकसाथ सभी योनियों में मानसिक रूप से प्रवेश कराए। आठ प्रकार के देवता, पाँच प्रकार के पशु, एक प्रकार का जन्म और चौदह प्रकार की मानव योनियाँ होती हैं। इन सभी में एकसाथ प्रवेश के लिए, गुरु को विधिपूर्वक शिष्य के आत्मा को वागीश्वरी स्वरूप में प्रतिष्ठित करना चाहिए। गर्भसिद्धि के लिए, देवता की पूजा, नमस्कार, आहुति आदि कर, सिद्ध फल का ध्यान करे। सिद्ध हुए शिष्य के लिए जन्म, स्थायित्व, सत्यता, भोग-प्राप्ति और परम तृप्ति हेतु संस्कार करे। प्रायश्चित्त, जन्म, आयु, भोग और संस्कार की सिद्धि के लिए, श्रेष्ठ गुरु तीन आहुति अर्पित कर, देवता से प्रार्थना करे। फिर, इस प्रकार करने के बाद, गुरु को चाहिए कि वह शिष्य के तीन बन्धनों को काट दे। चारों ओर से घेरने वाले बन्धनों को अत्यन्त विवेक से हटाकर, शिष्य के चैतन्य को शुद्ध और केवल वही मानना चाहिए। पूर्ण आहुति अग्नि में अर्पित कर, ब्रह्मा की पूजा करे; फिर तीन आहुति अर्पित कर, शिष्य को शिव का आदेश दे। हे पितामह! आपके द्वारा साधक को परम शैवपद प्राप्त न हो; एक विघ्न स्थापित करना चाहिए, क्योंकि यह शैव आदेश अत्यन्त महत्वपूर्ण है। इस प्रकार उपदेश देकर, पूजा कर, शिष्य को विधिपूर्वक मुक्त करे; महादेव की पूजा कर, तीन आहुति दे। पूर्ववत् निवृत्ति द्वारा शिष्य के शुद्ध आत्मा को निकालकर, अपने में और सूत्र में प्रतिष्ठित करे, फिर वागीश की पूजा करे। तीन आहुति अर्पित कर, प्रणाम और विधिपूर्वक विमोचन कर, निवृत्त होकर, योगयुक्त होकर, उस आत्मा की स्थापना करे।