एक समय की बात है, जब कोई साधक निष्कलंक होम की भावना से यज्ञ करना चाहता है, तो वह विधिपूर्वक अग्नि की स्थापना करता है। फिर, नियमों के अनुसार, घृत, समिधा और पके हुए अन्न से क्रमशः आहुति देता है। जब पात्र फिर से भर जाता है, तत्वों की शुद्धि के लिए, वह उन्हीं समिधाओं और अन्य सामग्री के साथ मूल मंत्र का उच्चारण करते हुए आहुति देता है। इस यज्ञ में पांच महाभूत, उनके सूक्ष्म रूप और पांच कर्मेंद्रियों का ध्यान किया जाता है। फिर ज्ञान और कर्म का भेद, कर्म के पांच विभाग, त्वचा आदि सात धातुएँ और पांच प्राणों का स्मरण करते हुए आहुति दी जाती है। मन, बुद्धि, अहंकार, विवेक, गुण, प्रकृति और पुरुष, आसक्ति, ज्ञान, शक्तियाँ, क्रम और काल—इन सबका भी ध्यान किया जाता है। इसके आगे, माया और शुद्ध ज्ञान, महेश्वर और सदाशिव, शक्ति और शिव तत्व—इन तत्वों को क्रमशः जानकर, शुद्ध मंत्रों से आहुति देने पर यजमान शुद्ध हो जाता है। शिव की कृपा प्राप्त कर वह वास्तव में ज्ञानवान बन जाता है। इसके पश्चात, गोबर लेकर उसे गोला बनाता है, मंत्रों से पवित्र करता है, अग्नि में डालता है और छिड़कता है। उसी दिन वह यज्ञ का प्रसाद ग्रहण करता है। चतुर्दशी की सुबह, पूर्ववर्णित सभी विधियों को संपन्न कर, उस दिन शेष समय उपवास करता है। प्रातःकाल, शुभ संधि के समय, इसी प्रकार होम कर, रुद्राग्नि की राख को सावधानीपूर्वक एकत्र करता है। अब साधक जटाधारी, मुण्डित या एक शिखाधारी होकर, स्नान करता है और दिशाओं को ही वस्त्र मानकर निर्लज्ज भाव से खड़ा होता है। अथवा वह गेरुए वस्त्र, चर्म, एक वस्त्र या वल्कल धारण कर सकता है और दंड तथा मेखला ले सकता है। फिर, पैर धोकर, बैठ जाता है और अपने शरीर को एकाग्र कर, शुद्ध अग्नि की राख को सावधानीपूर्वक लगाता है। छः अथर्वण मंत्रों से, जो 'अग्नि' से प्रारंभ होते हैं, वह सिर से लेकर पैरों तक क्रमशः अपने अंगों पर राख का लेप करता है। फिर, उसी क्रम में, राख लेकर, ओंकार या शिव नाम के साथ पूरे शरीर पर छिड़कता है। इसके बाद, वह ‘त्रियायुष’ नामक तीन रेखाएँ अंकित करता है, शिवत्व को प्राप्त करता है और फिर शिवयोग का अभ्यास करता है। साथ ही, तीनों संध्याओं का विधिपूर्वक पालन करता है। यही पाशुपत व्रत है, जो भोग और मोक्ष दोनों देता है तथा बंधन की अवस्था का नाश करता है। बंधनों को त्यागकर, पाशुपत व्रत को धारण करने के पश्चात, सनातन महादेव की लिंग रूप में पूजा करनी चाहिए। पूजा के लिए आठ पंखुड़ियों वाले स्वर्ण कमल का आसन बनाना चाहिए, जिसमें नौ रत्न जड़े हों और मध्य में केसरिया रेशा हो। यदि सामर्थ्य न हो, तो लाल या श्वेत कमल का आसन, और यदि वह भी न मिले, तो केवल ध्यान में ही आसन की कल्पना कर सकता है। फिर, एक छोटा लिंग, जो स्फटिक के पादपीठ पर हो, कमल के मध्य में स्थापित कर, विधिपूर्वक उसकी पूजा करता है। लिंग की स्थापना, शुद्धिकरण और आसन की तैयारी करके, वह पंचमुखी रूप का ध्यान करता है। फिर, अपनी सामर्थ्य के अनुसार, पंचगव्य और अन्य पदार्थों से तथा आठ स्रोतों के जल से उस लिंग का अभिषेक करता है। सुगंधित द्रव्यों, कपूर, चंदन, केसर आदि से लिंग और उसके पादपीठ का अभिषेक करता है और आभूषणों से सजाता है। बिल्वपत्र, लाल और श्वेत कमल, नीलकमल और अन्य सुगंधित पुष्पों से, साथ ही शुभ, उत्तम पत्रों, दूर्वा, अक्षत आदि विविध वस्तुओं से, महापूजा की विधि का पालन करते हुए, अपनी सामर्थ्य के अनुसार पूजा करता है। धूप, दीप और नैवेद्य भी अर्पित करता है, और अपनी शक्ति के अनुसार शुभ कृत्य करता है। इस व्रत में जितनी भी इच्छित और विशिष्ट वस्तुएँ उचित साधनों से प्राप्त हों, उन्हें विशेष रूप से अर्पित करना चाहिए। श्रीपत्र, नीलकमल और कमल—इनकी संख्या हजार-हजार बताई गई है; एक अन्य संख्या एक सौ आठ है। फिर भी, बिल्वपत्र कभी नहीं छोड़ना चाहिए; एक स्वर्ण कमल हजार कमलों से श्रेष्ठ माना गया है। नीलकमल आदि के लिए भी वही नियम है, जो बिल्वपत्र के लिए है; अन्य पुष्पों के लिए कोई बंधन नहीं—जो भी उपलब्ध हो, अर्पित किया जा सकता है। आठ प्रकार का अर्घ्य उत्तम है—विशेषकर धूप और लेप। वामदेव मुख के लिए चंदन और पुरुष मुख के लिए हरिताल दिया जाता है। कुछ कहते हैं कि ईशान मुख पर भस्म का लेप करना चाहिए; वहाँ धूप आवश्यक नहीं, क्योंकि वहाँ अन्य प्रकार की धूप—अघोर मुख के लिए श्वेत अगरु, मुख के लिए कृष्ण अगरु—नियत है। पुरुष मुख के लिए गुग्गुलु, बाईं ओर सौम्य मुख के लिए सुगंधित द्रव्य, और ईशान मुख के लिए विशेष रूप से उशीरा आदि धूप अर्पित की जाती है। शक्कर, मधु, कपूर, घृत और चंदन, अगरु आदि लकड़ियों के मिश्रण को सामान्य नैवेद्य माना गया है। कपूर की बत्ती घी में डुबोकर, फिर दीपों की पंक्ति अर्पित करनी चाहिए; प्रत्येक मुख को अर्घ्य और आचमन का जल देना चाहिए। पहले मंडल में क्रमशः हेरंब, षण्मुख और ब्रह्मा के अंगों की पूजा करनी चाहिए। दूसरे मंडल में विघ्नों के अधिपति और स्वामी, तीसरे मंडल में भव आदि आठ रूपों की पूजा करें। वहाँ महादेव और अन्य ग्यारह रूपों की उपस्थिति मानी गई है। चौथे मंडल में समस्त गणों के अधिपतियों की पूजा होती है। कमल के बाहर, पाँचवें मंडल में, दसों दिशाओं के रक्षक, अपने-अपने आयुधों और सेवकों सहित, क्रमशः पूजे जाते हैं। इस प्रकार, विधिपूर्वक, श्रद्धा और नियम से, साधक पाशुपत व्रत और शिवपूजन की पूर्णता को प्राप्त करता है।