भगवान शिव की दोनों सुंदर नेत्रों से जब जल की बूंदें गिरीं, तो उन्हीं आँसुओं की बूंदों से रुद्राक्ष वृक्ष का जन्म हुआ। यह वृक्ष, भक्तों को आशीर्वाद देने के लिए, वृक्ष रूप में पृथ्वी पर प्रकट हुआ और विष्णु के भक्तों सहित सभी चार वर्णों को प्रदान किया गया। शिव ने पृथ्वी, जल, गौड़ देश, मथुरा, अयोध्या, लंका, मलय, सह्याद्रि पर्वत, काशी और अन्य अनेक स्थानों में रुद्राक्ष उत्पन्न किए। ये रुद्राक्ष महान पापों का नाश करने वाले माने जाते हैं और शास्त्रों में इनकी प्रशंसा की गई है। शिव के आदेश से ब्राह्मण, क्षत्रिय, वैश्य और शूद्र—जो भी पृथ्वी पर जन्म लेते हैं—उन्हें अपने-अपने वर्ण के अनुसार शुभ रुद्राक्ष धारण करना चाहिए। इनकी चार रंगों में—श्वेत, लाल, पीला और काला—पहचान की जाती है, और ज्ञानी लोग कहते हैं कि प्रत्येक को अपने वर्ण के अनुसार रंग का रुद्राक्ष पहनना चाहिए। रुद्राक्ष को धारण करने से जो फल प्राप्त होता है, वह भोग या मोक्ष की इच्छा रखने वालों के लिए, विशेषकर शिव-भक्तों के लिए, शिव और पार्वती की प्रसन्नता के लिए सदा उत्तम है। आंवले के फल के आकार का रुद्राक्ष श्रेष्ठ माना गया है, बेर के आकार का मध्यम है, और सबसे छोटा, केवल एक दाने के बराबर, न्यूनतम माना गया है। पार्वती, जो रुद्राक्ष बेर के समान आकार का है, वह भी संसार में सुख और सौभाग्य बढ़ाता है। आंवले के आकार वाला रुद्राक्ष सभी आपदाओं का नाश करता है, और गुंजा बीज के समान रुद्राक्ष सभी इच्छाओं की पूर्ति करता है। रुद्राक्ष जितना हल्का होता है, उसका फल उतना ही अधिक होता है, और ज्ञानी कहते हैं कि प्रत्येक दाने का फल दस गुना बढ़ जाता है। रुद्राक्ष धारण करना पापों के नाश का साधन बताया गया है, इसलिए सभी कार्यों की सिद्धि के लिए इसे अवश्य पहनना चाहिए। संसार में रुद्राक्ष की माला जितनी शुभ और फलदायी है, वैसी कोई अन्य माला नहीं है। जो रुद्राक्ष चिकने, दृढ़, बड़े और कांटेदार होते हैं, वे सदा इच्छाओं, भोग और मोक्ष देने वाले, शुभ माने गए हैं। कीड़ों से ग्रसित, टूटे, फटे, बिना कांटे के, घाव वाले या विकृत रुद्राक्ष का त्याग करना चाहिए। स्वाभाविक छिद्र वाला रुद्राक्ष उत्तम है, जबकि मनुष्य द्वारा छिद्र किया गया रुद्राक्ष मध्यम माना गया है। रुद्राक्ष धारण करने से महान पापों का नाश होता है; और यदि कोई सौ रुद्राक्ष धारण करता है, तो वह व्यक्ति स्वयं रुद्र के समान स्वरूप को प्राप्त करता है। ग्यारह सौ रुद्राक्ष धारण करने से जो फल मिलता है, वह सौ वर्षों में भी पूरा वर्णित नहीं किया जा सकता। पाँच सौ पचास रुद्राक्षों का मुकुट उचित माना गया है, और श्रेष्ठ भक्त को उसे विधिपूर्वक बनाना चाहिए। तीन सौ साठ रुद्राक्षों की तीन बार माला बनाकर जनेऊ तैयार करना चाहिए। जटा में तीन, बाएँ और दाएँ कान में छः-छः रुद्राक्ष धारण करने का विधान है। गले और भुजाओं में एक सौ एक रुद्राक्ष, और कोहनी पर रत्न बांधना चाहिए। शिव-भक्तों को तीन जनेऊ पहनना चाहिए, और शेष पाँच रुद्राक्ष कमर में धारण करने चाहिए। इस प्रकार धारण किए गए रुद्राक्ष की पूजा और सम्मान उसी प्रकार करना चाहिए जैसे महेश्वर की पूजा की जाती है। जब कोई इस रूप में बैठकर ध्यान करता है और ‘शिव’ नाम का उच्चारण करता है, तो उसके पाप नष्ट हो जाते हैं। एक हजार से अधिक रुद्राक्ष धारण करने का विधान बताया गया है; यदि यह संभव न हो, तो एक अन्य शुभ विधि भी बताई गई है—जटा में एक, सिर पर तीस, गले में पचास, भुजाओं में सोलह-सोलह, कलाई में बारह, कंधों पर दो-दो, और कुल पाँच सौ रुद्राक्ष धारण करना चाहिए। एक सौ आठ रुद्राक्षों की माला और जनेऊ बनानी चाहिए। जो व्यक्ति इस प्रकार एक हजार रुद्राक्ष नियमपूर्वक पहनता है, उसे सभी देवता उसी प्रकार सम्मान देते हैं जैसे वे रुद्र को देते हैं। एक विधि के अनुसार, जटा में एक, सिर पर चालीस, कंठ में बत्तीस, वक्षस्थल पर एक सौ आठ, कानों में एक-एक, भुजाओं में छह-छह, अग्रबाहु में सोलह-सोलह, और हाथों में दुगुने रुद्राक्ष पहनने का विधान है। जो भक्त श्रद्धा और विधिपूर्वक रुद्राक्ष धारण करता है, वह जन्मना शैव भी हो, तो भी शिव के समान पूजनीय और बार-बार वंदनीय होता है। सिर पर ईशान मंत्र, कानों पर तत्पुरुष मंत्र, गले पर अघोर मंत्र, और हृदय पर भी अघोर बीज मंत्र से रुद्राक्ष पहनना चाहिए। हाथों में अघोर बीज मंत्र से, पेट पर पंद्रह अक्षरों वाले वामदेव मंत्र से रुद्राक्ष धारण करना चाहिए। पाँच ब्रह्म मंत्रों से तीस मालाएँ और पाँच या सात, अथवा वाम के मूल मंत्र से सभी रुद्राक्ष धारण किए जा सकते हैं। रुद्राक्ष धारण करने के बाद, मदिरा, मांस, लहसुन, प्याज, कुल्थी, कफकारक भोजन, मल और सूअर का सेवन त्यागना चाहिए। ब्राह्मणों के लिए एक लाख, क्षत्रियों के लिए लाल, संन्यासियों के लिए प्रसन्नता देने वाले, वैश्य के लिए बार-बार पिये गए, शूद्रों के लिए काले और हाथी जैसे रुद्राक्ष शास्त्रों में बताए गए हैं। चारों वर्ण, गृहस्थ और संन्यासी, सभी को नियमपूर्वक रुद्राक्ष धारण करना चाहिए; यह परम रहस्य जन्म से कभी नहीं छोड़ना चाहिए। पुण्यात्मा ही रुद्राक्ष धारण करते हैं, और इसका त्याग करने से सभी नरकों की प्राप्ति होती है। सबसे पहले आंवले से हल्के, फिर दोषयुक्त, कांटे से कटे, कीड़ों द्वारा खाए गए, या शरीर में छेद वाले रुद्राक्ष—इनका त्याग करना चाहिए। अंत में, चने के समान छोटे रुद्राक्ष भी त्याज्य हैं; निष्कलंक, सूक्ष्म और शुभ रुद्राक्ष सदैव प्रशंसनीय माने गए हैं।