একাগ্রচিত্তে সাধক তাঁর পূজার আয়োজন শুরু করেন। প্রথমে তিনি কল্পনা করেন, দেবতার অঙ্গসমূহ রাজকীয় রত্নের মতো দীপ্তিমান, আর তার উপরে বিশুদ্ধ শ্বেতপদ্মাসনে স্থাপিত হয়েছে দেবতার আসন। এই পদ্মাসনের আটটি পাপড়ি আছে, যেগুলি অণিমা প্রভৃতি আটটি সিদ্ধির প্রতীক। বামদিক থেকে শুরু করে পাপড়ির রেণুগুলি রুদ্র ও বামশক্তির রূপে কল্পিত হয়। পদ্মের বীজের মধ্যেও এই শক্তিগুলি বিরাজমান, উন্মনী পর্যন্ত বিস্তৃত। অন্তঃস্থ গর্ভ বা কুণ্ডটি হল পরম বৈরাগ্য, আর তার ডাঁটা জ্ঞানের প্রতীক, যা শিবতত্ত্বের প্রকাশ। ডাঁটার শেষপ্রান্তে তিনটি বৃত্তের মধ্যে শিব ও ধর্মতত্ত্বের মূল বা কন্দ রয়েছে। এই তিন বৃত্তের উপরে আত্মা প্রভৃতি তিনটি তত্ত্ব আসনেরূপে কল্পিত হয়। সব আসনের উপরে আবার এক আরামদায়ক আসন বিছানো হয়, যা নানা আবরণে আবৃত, দিব্য ও বিশুদ্ধ জ্ঞানময়। এরপর সাধক যথাযথভাবে আহ্বান, প্রতিষ্ঠা, সংরক্ষণ ও দর্শন এবং পৃথকভাবে মুদ্রার মাধ্যমে নমস্কার করেন। এরপর তিনি দেবতার পদ্য, আচমন, অর্ঘ্য, গন্ধ, পুষ্প, ধূপ, দীপ ও তাম্বুল নিবেদন করেন এবং শেষে শিবকে বিশ্রাম দেন। আবার, এইভাবে আসন ও প্রতিমা প্রস্তুত করে, মূল মন্ত্র ও অন্যান্য ব্রহ্মমন্ত্র দ্বারা সম্পূর্ণ করে, সাধক দেবীসহ শিবকে আহ্বান করেন। শিব—যিনি সর্বশক্তির কারণ, অচল, অবিনশ্বর, নির্মল স্ফটিকের মতো দীপ্তিমান—তাঁকে আহ্বান করা হয়। তিনি সমস্ত জগতের কারণ, সর্বোচ্চ, সমস্ত জগতের সারতত্ত্ব। ভক্তরা সহজেই তাঁকে দর্শন করেন, তিনি অবিনশ্বর ঈশ্বর, যাঁকে ব্রহ্মা, ইন্দ্র, বিষ্ণু, রুদ্ররাও উপলব্ধি করতে পারেন না। জ্ঞানীরা তাঁকে দেবতাদের সারতত্ত্ব বলে জানেন, তিনি ইন্দ্রিয়াতীত, অনাদি, অনন্ত, ও সংসার-দুঃখের পরিত্রাতা। এই শিবতত্ত্বই জগতে তাঁর চিরন্তন উদ্দেশ্য; তাই পরম ভক্তি ও পঞ্চোপচার দ্বারা শিবলিঙ্গের পূজা করা উচিত। লিঙ্গই মহেশ্বর শিবের স্বরূপ, পরমাত্মা। তাঁর স্নানের সময় শুভ মঙ্গলধ্বনি দিয়ে ক্রিয়া শুরু করতে হয়। গো-সম্পর্কিত পাঁচ দ্রব্য—ঘি, দুধ, দই, মধু প্রভৃতি, মূলে, নানা ফলের নির্যাস, তিল, সরিষা, বিভিন্ন ময়দার তৈরি দ্রব্য, যব প্রভৃতি শস্য, মাষকলাইয়ের গুঁড়ো দিয়ে লিঙ্গকে স্নান ও অভিষেক করা হয়। এরপর উষ্ণজলে স্নান করিয়ে, বিল্বপত্র ও অনুরূপ দ্রব্য দিয়ে পূর্বের প্রলেপ ও সুগন্ধি দূর করা হয়; তারপর আবার জল দিয়ে স্নান সম্পন্ন হয়, রাজধর্ম অনুসারে। এরপর গন্ধযুক্ত আমলকি ও হলুদ নিবেদন করা হয়, তারপর শুদ্ধজলে লিঙ্গ বা প্রতিমা পরিশুদ্ধ করা হয়। সুগন্ধি জল, কুশ ও ফুলমিশ্রিত জল, সোনা ও রত্নমিশ্রিত মন্ত্র-শক্তিপ্রাপ্ত জল দিয়ে যথাযথভাবে স্নান করানো হয়। যদি সব দ্রব্য না পাওয়া যায়, তাহলে যা আছে তাই দিয়ে, বা শুধু মন্ত্র-শক্তিযুক্ত জল দিয়েই ভক্তি সহকারে শিবের স্নান করা উচিত। এরপর ঘট, শঙ্খ, বৃদ্ধি-পাত্র, অথবা হাত, কুশ ও ফুল দিয়ে মন্ত্রপাঠসহ স্নান করাতে হয়। পবমান, রুদ্র, নীল, ত্বরিতা স্তোত্র, লিঙ্গসূক্ত ও অন্যান্য স্তোত্র, এবং অথর্বশিরস্ পাঠ করে, ঋগ্বেদ, সামবেদ, শৈব ব্রাহ্মণ স্তোত্র, শিবপ্রণব মন্ত্র দিয়ে দেবাদিদেব শিবের স্নান সম্পন্ন হয়। যেভাবে দেবতার স্নানাদি ক্রিয়া সম্পন্ন হয়, ঠিক সেভাবেই দেবীরও করা উচিত; কারণ তাঁদের মধ্যে কোনো পার্থক্য নেই। প্রথমে দেবতার স্নানাদি, তারপর দেবীর, দেবাদিদেবের আদেশ অনুসারে। অর্ধনারীশ্বর পূজায় কোনো অগ্রাধিকার নেই; সেই ক্ষেত্রে লিঙ্গে বা অন্যত্র উপযুক্তভাবে নিবেদন করা যায়। বিশুদ্ধ ও সুগন্ধি দ্রব্য দিয়ে লিঙ্গের অভিষেক শেষে, তা কাপড়ে মুছে, বস্ত্র ও জজ্ঞোপবীত নিবেদন করা হয়। এরপর পদ্য, আচমন, অর্ঘ্য, গন্ধ, পুষ্প, অলঙ্কার, ধূপ, দীপ, নৈবেদ্য, পানীয় জল ও মুখশুদ্ধির উপকরণ নিবেদন করা হয়। আবার আচমন ও মুখশুদ্ধির সুগন্ধি দেওয়া হয়; তারপর নানা রত্নখচিত সুন্দর, মঙ্গলময় মুকুট নিবেদন হয়। বিশুদ্ধ অলঙ্কার, নানাবিধ মালা, চামর, ছাতা, তালপাতার পাখা, আয়না নিবেদন করা হয়। দীপ নিবেদন শেষে, সব শুভ শব্দ, গীত, নৃত্য ও জয়ধ্বনির সঙ্গে পূজা সম্পন্ন হয়। সোনার, রূপার, তামার বা মঙ্গলময় মাটির পাত্রে পদ্ম, সুন্দর ফুল, বীজ, দই, অক্ষত ইত্যাদি সাজানো হয়। ত্রিশূল, যুগ্ম শঙ্খ, পদ্ম, নন্দ্যাবর্ত, গোবরচিহ্ন, শ্রীবৎস, স্বস্তিক, আয়না, বজ্র, অগ্নি ও অন্যান্য শুভ চিহ্নে পাত্রটি অলঙ্কৃত হয়। আটটি প্রদীপ চারপাশে ও একটি কেন্দ্রে স্থাপন করে, বামদিক থেকে শুরু করে দেবীসমূহ কল্পনা করে, নয় শক্তির পূজা করা হয়। রক্ষামন্ত্র দ্বারা আবৃত করে, চারিদিকে অস্ত্র দ্বারা রক্ষা করে, দুই হাতে গোমুদ্রা দেখিয়ে, পাত্রটি উত্তোলন করা হয়। বিকল্পভাবে, পাঁচটি দীপ পাত্রে, বা দিকসমূহে ও কেন্দ্রে একটি দীপ, অথবা একটিমাত্র দীপও স্থাপন করা যায়। এরপর সেই পাত্রটি মূলমন্ত্র উচ্চারণ করে, লিঙ্গ বা প্রতিমার চারপাশে তিনবার প্রদক্ষিণ করা হয়। এরপর শিরে অর্ঘ্য ও সুগন্ধি ভস্ম নিবেদন করা হয়; হাতে ফুল দিয়ে নৈবেদ্য নিবেদন করা হয়। তারপর জল, মুখশুদ্ধির জন্য জল, ও পাঁচরকম সুগন্ধিযুক্ত তাম্বুল নিবেদন করা হয়। এরপর ছিটানো ও ছড়ানো দ্রব্য দিয়ে, গীত-নৃত্য আয়োজন করে, লিঙ্গে শিব ও অন্যান্য দেবতাকে ধ্যান করে, নিরবে শক্তিমন্ত্র জপ করা হয়। এইভাবেই বিধিপূর্বক পরমেশ্বর শিবের পূজা সম্পন্ন হয়।