শিষ্য যখন মণ্ডলটি দর্শন করে, তখন সে আবার ভক্তিভরে করজোড়ে ভগবানকে প্রণাম করে। এরপর শিবাচার্য দক্ষিণ দিকে মণ্ডলের পাশে আসন গ্রহণ করেন এবং নিজের বাঁ দিকে কুশাসনে শিষ্যকে বসান। মহাদেবের পূজা সম্পন্ন করে, তিনি শিবমুদ্রা স্থাপন করেন। শিবের দীপ্তি নিজের হাতে ধারণ করে, শিবমন্ত্র জপ করেন এবং শিবভক্তিতে পরিপূর্ণ হয়ে সেই হাত শিষ্যের মস্তকে রাখেন। এরপর আচার্য শিষ্যের দেহে সম্পূর্ণ আশ্রয়-মুদ্রা প্রয়োগ করেন। শিষ্য তখন গুরুতে ঈশ্বররূপ দর্শন করে ভূমিতে দণ্ডবৎ প্রণাম করে। এরপর শিবাগ্নিতে যথাবিধি ভগবানের পূজা করে, তিনবার আহুতি দিয়ে, পূর্বের মতো শিষ্যকে আসনে বসান। আচার্য কুশাগ্রের দ্বারা শিষ্যকে স্পর্শ করেন এবং জ্ঞানের দ্বারা শিষ্যের অন্তরে প্রবেশ করেন; মহাদেবকে প্রণাম করে, তিনি নাড়ি-সংযোগের ক্রিয়া সম্পন্ন করেন। শিবশাস্ত্রে নির্দিষ্ট পদ্ধতিতে, শ্বাস ত্যাগ করে, সেই শ্বাসপথ দিয়ে শিষ্যের দেহে প্রবেশ করেন এবং স্মরণপূর্বক মন্ত্রসমূহকে তুষ্ট করেন। মূলমন্ত্রের সন্তুষ্টির জন্য দশবার আহুতি দেন এবং প্রত্যঙ্গের জন্য যথাক্রমে তিনবার করে নির্দিষ্ট মন্ত্রে আহুতি দেন। এরপর প্রায়শ্চিত্তের জন্য পূর্ণাহুতি দিয়ে, মন্ত্রজ্ঞ আচার্য আবার মূলমন্ত্রে দশবার আহুতি দেন। পুনরায় দেবতাদের দেবতা শিবের পূজা ও শুদ্ধিকরণ সম্পন্ন করে, নিয়মমাফিক আহুতি দিয়ে, তিনি বৈশ্যকে নিজ জাতিতে উত্তীর্ণ করেন। এভাবে তিনি ক্ষত্রিয়ত্ব উৎপন্ন করেন এবং একইভাবে ব্রাহ্মণ্যও দেন। রাজন্যকে ব্রাহ্মণ করে, এরপর উভয়ের মধ্যে রুদ্রত্ব উৎপন্ন করেন; ব্রাহ্মণের মধ্যে রুদ্রনাম প্রতিষ্ঠা করেন। শিশুকে ছিটিয়ে ও সামান্য আঘাত দিয়ে, নিজের অন্তরে অনুভব করেন—আমার আত্মা শিবতুল্য, যেন জ্বলা স্ফুলিঙ্গের মতো দীপ্ত। নির্ধারিত নিয়মে, শ্বাস নির্গত করে, সেই নাড়িপথে শিষ্যের হৃদয়ে প্রবেশ করেন। সেখানে প্রবেশ করে, শিষ্যের চেতনায় ধ্যান করেন—যা নীল বিন্দুর মতো দীপ্ত ও নিজের জ্যোতিতে পবিত্র। সেই চেতনা নাড়িপথে গ্রহণ করে, প্রত্যাহার-মুদ্রায়, তিনি তা শ্বাসপ্রক্রিয়ায় স্থাপন না করে, নিজের সঙ্গে ঐক্যের জন্য ধারণ করেন। এরপর কুম্ভক ও পুনরায় পূর্বের মতো শ্বাসত্যাগে, তা শিষ্যের হৃদয়ে স্থাপন করেন। শিব থেকে প্রাপ্ত সেই শক্তি দিয়ে, শিষ্যকে উপনয়নের সূত্র প্রদান করেন এবং তিনবার আহুতি দিয়ে পূর্ণাহুতি দেন। শিষ্যকে দেবতার দক্ষিণে, কুশ ও ফুলে সাজানো উৎকৃষ্ট আসনে, উত্তরমুখে, করজোড়ে বসান। নিজে পূর্ণ ও বিশুদ্ধ আসনে, পূর্বমুখে, স্বস্তিকাসনে বসে, কল্যাণময় ধ্বনিতে মন্ত্র পাঠ করেন। পূর্ণ ও বিশুদ্ধ ঘট নিয়ে, শিবে ধ্যানস্থ হয়ে, শিষ্যকে অভিষেক করেন। এরপর শিষ্য স্নান করে, শুভ্র বস্ত্র পরিধান করে, শুদ্ধ হয়ে, অলঙ্কৃত হয়ে, করজোড়ে মণ্ডপে উপস্থিত হয়। পূর্বের মতো কুশাসনে শিষ্যকে বসিয়ে, আচার্য মণ্ডলে দেবতার পূজা ও হস্তমুদ্রা করেন। দেবতাকে মনে ভস্মরূপে ধ্যান করে, শিশুকে হাতে স্পর্শ করে উচ্চারণ করেন—“শিব”। এরপর শিবাচার্য দাহন, শৌচাদি কর্ম সম্পন্ন করে, মাতৃকা-ন্যাসের পথ অনুযায়ী পূর্ণ ক্রিয়া করেন। এরপর শিবাসনে ধ্যান করে, শিষ্যের মস্তকে শিবকে আহ্বান করে, সেখানে মানসিকভাবে যথাবিধি পূজা করেন। করজোড়ে দেবতার কাছে প্রার্থনা করেন—“সদা এখানে বিরাজ করুন”—এভাবে অনুরোধ করে শম্ভুর জ্যোতি স্মরণ করেন। শিবের পূজা করে, শৈব-শাসন লাভ করে, শিবমন্ত্র মৃদুভাবে শিষ্যের কানে উচ্চারণ করেন। শিষ্য করজোড়ে, মন্ত্র শ্রবণ করে, মনোযোগে নিমগ্ন হয়ে, গুরু-নির্দেশিতভাবে ধীরে ধীরে মন্ত্র জপ করেন। এরপর মন্ত্রবিশারদ গুরু, শাক্তমন্ত্র শিক্ষা দিয়ে উচ্চারণ করেন এবং শিষ্যকে আশীর্বাদ করেন। এরপর, মন্ত্রের অর্থ ও বাচ্য-বাচক-সম্পর্ক বিচার করে, ভগবানের রূপ নির্দেশ করেন এবং ধ্যানের আসন নির্ধারণ করেন। এরপর গুরুর আদেশে, শিষ্য শিব, অগ্নি ও গুরুর সম্মুখে, মনে সংকল্প করে, ভক্তিসহকারে দীক্ষাবাক্য উচ্চারণ করেন। এমনকি জীবন ত্যাগ করাও, বা মাথা কেটে গেলেও, কল্যাণময় ত্রিনয়নের পূজা না করে কিছু গ্রহণ করার চেয়ে শ্রেয়। যতক্ষণ মোহ ও বিভ্রান্তি থাকে, ততক্ষণ শৃঙ্খলা বজায় রেখে দান করা উচিত; ততদিন দেবতার পূজা, একাগ্রচিত্তে ও ভক্তিতে করা উচিত। এরপর, শিবমঠে এটিই 'সময়' স্তর নামে পরিচিত; এখানেই শিষ্য কর্তৃত্ব লাভ করে, গুরুর আদেশে, তাঁর অধীনে থাকে। এরপর, দুই হাত নিচে রেখে, নিজের হাতে ভস্ম তুলে শিষ্যকে দেন, সাথে মন্ত্রাবদ্ধ রুদ্রাক্ষও দেন। সম্ভব হলে, দেবতার প্রতিমা বা গোপন মূর্তি, পূজা, উপহার, জপ ও ধ্যানের উপকরণও প্রদান করেন। শিষ্য, শিবাচার্যের কাছ থেকে এসব গভীর শ্রদ্ধায় গ্রহণ করে, গুরুর আদেশেই তা গ্রহণ করে, অন্যথা নয়। সবকিছু গুরুর কাছ থেকে পেয়ে, তা মাথায় ধারণ করে, রক্ষা করে এবং মঠে বা গৃহে শম্ভুর পূজা করেন। শেষে, আচার্য শিষ্যকে তাঁর ভক্তি, বিশ্বাস ও উপলব্ধি অনুসারে শৈবাচার শিখিয়ে দেন।