শুভ দিন নির্ধারিত হলে এবং পুনরায় শঙ্করদেবের পূজা সম্পন্ন করার পর, আচার্য ভগবানের কাছে শিষ্যদের কল্যাণের জন্য প্রার্থনা করেন। তিনি ভগবানকে বলেন, ‘‘হে দেবাদিদেব, আমার দেহে প্রবেশ করুন; হে বিশ্বনাথ, হে করুণাসাগর, আপনার কৃপায় এই শিষ্যকে মুক্ত করুন।’’ এরপর, অনুমতি নিয়ে, আচার্য উপবাসী অথবা হোমের অন্নভোজী শিষ্যকে নিয়ে আসেন। শিষ্য একবেলা আহার করেন, সংযমী, স্নান ও প্রাতঃকৃত্য সম্পন্ন করেন, প্রণব মন্ত্র জপ করেন, ঈশ্বরের ধ্যান করেন এবং সমস্ত শুভকর্ম সম্পূর্ণ করেন। শিষ্যকে উত্তরমুখী করে, কুশাসন বসিয়ে, মণ্ডলের পশ্চিম বা দক্ষিণ প্রবেশদ্বারের সম্মুখে স্থাপন করা হয়। আচার্য নিজে পূর্বদিকে মুখ করে, দেহ সোজা রেখে, ভক্তিভরে করজোড়ে দাঁড়িয়ে, অস্ত্রমুদ্রা দ্বারা পবিত্র জল শিষ্যের মস্তকে ছিটিয়ে দেন। একটি পুষ্প দিয়ে স্পর্শ করে, নতুন ও অভিষিক্ত বস্ত্রের অর্ধাংশ দিয়ে শিষ্যের চোখ বাঁধেন। এরপর, আচার্য শিষ্যকে মণ্ডলের প্রবেশদ্বার দিয়ে নিয়ে যান; শিষ্য এভাবে পরিচালিত হয়ে শম্ভুর চারিদিকে তিনবার প্রদক্ষিণ করেন। এরপর শিষ্য পূর্ব বা উত্তরমুখী হয়ে, সোনা মিশ্রিত পুষ্পমঞ্জরি ভগবানে অর্পণ করে, ভূমিতে দণ্ডায়মান প্রণাম করেন। পুনরায় পূর্বের মতো মূলমন্ত্র ও অস্ত্রমুদ্রা দ্বারা মস্তকে জল ছিটিয়ে, চোখের বাঁধন খুলে দেন। মণ্ডল দর্শন করে, শিষ্য করজোড়ে ভগবানে প্রণাম করেন। তখন শিবাচার্য মণ্ডলের দক্ষিণে আসনে আসীন হন এবং শিষ্যকে নিজের বামে কুশাসনে বসান। মহাদেবের পূজা করে, শিবমুদ্রা স্থাপন করেন। নিজ হাতকে শিবের জ্যোত্স্নায় অভিষিক্ত করে, শিবমন্ত্র জপ করেন এবং শিবভক্তিতে পূর্ণ হয়ে, শিষ্যের মস্তকে হাত রাখেন। এরপর, সম্পূর্ণ দেহে সংযোগমুদ্রা করেন; শিষ্য, যিনি এখন ঈশ্বরতুল্য গুরু, তাঁকে ভূমিতে দণ্ডায়মান হয়ে প্রণাম করেন। পরে, শিবাগ্নিতে যথাযথ পূজা করে, তিনপ্রকার হোম সম্পন্ন করে, পূর্বের মতো শিষ্যকে আসনে বসিয়ে পরবর্তী কার্যক্রমে অগ্রসর হন। কুশাগ্রের অগ্রভাগে শিষ্যকে স্পর্শ করে, আচার্য জ্ঞানের দ্বারা শিষ্যের মধ্যে প্রবেশ করেন; মহাদেবকে প্রণাম করে, নাড়ির সংযোগ সম্পন্ন করেন। শাস্ত্রবিধি অনুযায়ী, শ্বাসত্যাগ করে শিষ্যের দেহে প্রবেশ করেন এবং স্মরণ দ্বারা মন্ত্রসমূহকে তৃপ্ত করেন। মূলমন্ত্রের সন্তুষ্টির জন্য দশবার এবং অঙ্গমন্ত্রের জন্য তিনবার যথাক্রমে হোম করেন। পরে, প্রায়শ্চিত্ত হোম করে, পুনরায় দশবার মূলমন্ত্রে আহুতি দেন। পুনরায় দেবাদিদেবের পূজা ও শুদ্ধিকরণ করে, বিধি অনুযায়ী আহুতি দিয়ে, বৈশ্যকে নিজ জাতিতে উন্নীত করেন। একইভাবে, তিনি ক্ষত্রিয়ত্ব উৎপাদন করেন এবং একই প্রক্রিয়ায় ব্রাহ্মণ্যও দান করেন। রাজন্যকে ব্রাহ্মণত্বে উন্নীত করে, উভয়ের মধ্যে রুদ্রত্ব উৎপাদন করেন; ব্রাহ্মণের মধ্যে রুদ্রনাম প্রতিষ্ঠা করেন। শিশুকে ছিটিয়ে ও স্পর্শ করে, নিজের অন্তরে শিবতত্ত্বের ঝলমলে স্ফুলিঙ্গের মতো স্বরূপ স্মরণ করেন। নির্দেশিত পদ্ধতিতে, নির্দিষ্ট নাড়ি দিয়ে শ্বাসত্যাগ করেন এবং সেই নাড়ি দিয়ে শিষ্যের হৃদয়ে প্রবেশ করেন। সেখানে, শিষ্যের চৈতন্যকে নীল বিন্দুর মতো উজ্জ্বল ও নিজ জ্যোত্স্নায় পাপমুক্ত রূপে স্মরণ করেন। ঐ চৈতন্যকে ঐ নাড়ি দ্বারা গ্রহণ করে, প্রত্যাহারমুদ্রায় স্থাপন করেন, কিন্তু প্রশ্বাসে নয়—বরং আত্মসংযোগের জন্য। পরে, কুম্ভক ও পুনরায় রেচক দ্বারা, সেই চৈতন্য শিষ্যের হৃদয়ে প্রতিষ্ঠা করেন। শিব থেকে প্রাপ্ত ঐ তত্ত্ব শিষ্যকে উপনয়নসূত্র দান করেন এবং তিনবার আহুতি দিয়ে সম্পূর্ণ আহুতি দেন। শিষ্যকে দেবতার দক্ষিণে উৎকৃষ্ট আসনে, কুশ ও পুষ্পে আচ্ছাদিত আসনে, করজোড়ে ও উত্তরমুখী বসান। নিজে উৎকৃষ্ট আসনে পূর্বমুখে বসে, স্বস্তিকাসনে থেকে মহাশুভ ধ্বনিতে মন্ত্রোচ্চারণ করেন। পূর্ণ ও বিশুদ্ধ পাত্র নিয়ে, শিবের ধ্যান করে, আচার্য শিষ্যকে অভিষিক্ত করেন। পরে, শিষ্য স্নান করে, শুভ্র বসনে, শুদ্ধ হয়ে, নিজেকে অলঙ্কৃত করে, করজোড়ে মণ্ডপে উপস্থিত হন। পূর্বের মতো কুশাসনে বসিয়ে, আচার্য দেবতার পূজা করেন ও মণ্ডলে হস্তমুদ্রা সম্পাদন করেন। তদনন্তর, দেবতাকে ভস্মরূপে মনে রেখে, শিষ্যকে স্পর্শ করে ‘‘শিব’’ উচ্চারণ করেন। শিবাচার্য দহন, স্নান ও অন্যান্য কার্যাদি সম্পাদন করে, মাত্ৰিকান্যাস-পদ্ধতিতে পূর্ণ আচরণ করেন। পরে, শিবাসনে ধ্যান করে, শিষ্যের মস্তকে শিবকে আহ্বান করেন এবং মানসিকভাবে যথাবিধি পূজা করেন। করজোড়ে দেবতাকে প্রার্থনা করেন—‘‘আপনি সদা এখানে বিরাজ করুন’’—এভাবে অনুরোধ করে শম্ভুর দীপ্তি স্মরণ করেন। শিবের পূজা ও শৈব-আজ্ঞা প্রাপ্তির পর, যা শিবতত্ত্ব, মৃদুস্বরে শিবমন্ত্র শিষ্যের কানে উচ্চারণ করেন। শিষ্য করজোড়ে, মনোযোগসহ মন্ত্র শ্রবণ করে, গুরুপ্রদত্ত নিয়মে ধীরে ধীরে তা জপ করেন। পরে, মন্ত্রবিশারদ আচার্য শিষ্যকে শক্তিমন্ত্র শিক্ষা দিয়ে উচ্চারণ করেন এবং কল্যাণকামনা করেন।