आचार्य ने विधिपूर्वक आचमन की प्रक्रिया आरंभ की। सबसे पहले, उन्होंने वासुदेव और प्रद्युम्न नामों के उच्चारण के साथ अपनी नासिका को स्पर्श किया। फिर, अधोक्षज और नृसिंह के नामों का स्मरण करते हुए अपने कानों को छुआ। इसके बाद, हरि और विष्णु के नामों के साथ यह वैष्णव आचमन कहलाया। मुख, नासिका, तर्जनी अंगुली, नेत्र और कान—इन सभी अंगों पर आत्मज्ञान और शिव से संबंधित तत्त्वों के साथ, ‘स्वाहा’ शब्द के साथ शैव विधि का विधान किया गया। केवल आत्मज्ञान और शिव के तत्त्वों के साथ, ‘स्वाहा’ और ‘वसाना’ जैसे अंत वाले शब्दों का प्रयोग कर शैव आचमन संपन्न किया जाता है। द्विजों के लिए यह लाभकारी आचमन वाणी, लज्जा और श्री के शब्दों के साथ निर्दिष्ट है। आचार्य ने हृदय में नंदक तलवार का ध्यान किया, दोनों भुजाओं में शंख और चक्र का स्मरण किया। फिर, कानों की जड़ों, दोनों ओर, पीठ, नाभि और पीठ के कूबड़ पर भी ध्यान केंद्रित किया। अग्निहोत्र से उत्पन्न भस्म को लेकर, त्र्यम्बक नाम का उच्चारण किया और फिर क्रमशः तत्पुरुष, अघोर, सद्योजात आदि नामों के साथ तिलक लगाया। शैव या शाक्त साधक को त्रिकोण तिलक करना चाहिए, या स्त्री के लिए जैसा उचित हो वैसे करना चाहिए। नियमपूर्वक आचमन करने के पश्चात, मंत्रद्रष्टा ने फिर से पवित्र जल का आवाहन किया। तत्पश्चात, हे प्रभु, उस जल से सिर को सात बार अभिषिक्त किया। बाएँ हाथ में जल लेकर, दाहिने हाथ की हथेली से उसे ढँक दिया। जड़ से गिरती बूँदों के साथ सत्य मुद्रा का प्रयोग किया गया। उस अक्षर को बनाकर, उसे नासिका के अग्रभाग के समीप लाया गया। उसी के द्वारा आंतरिक अपवित्रता को धोया गया; फिर उसी जल से, उसे शस्त्र के समान दूर फेंक दिया गया, और फिर पहले से तैयार वज्र-शिला पर डाला गया। इसके बाद, जैसा पूर्व में बताया गया, हाथ धोकर, मंत्रज्ञ ने मुख को भी शुद्ध किया। आहुति अर्पित करते हुए, जड़ से लेकर अंत तक मंत्र का उच्चारण किया गया। इस प्रकार तीन बार आहुति देकर, सूर्य में स्थित देवता का ध्यान किया गया। अथवा, गुप्त मंत्र को मन ही मन अठ्ठाईस बार अर्पित किया गया। इसके पश्चात, आचार्य ने काले मृगचर्म में, तारों से अंकित वस्त्र में ब्राह्मी देवी का ध्यान किया। फिर, श्वेत वस्त्रधारी, वृषभ पर सवार, त्रिनेत्री, सूर्य-चिह्न से युक्त देवी का ध्यान किया। संध्या समय, आभूषणों से अलंकृत, पीले रेशमी वस्त्रधारी देवी का ध्यान किया गया। गदा और कमल धारण किए, सूर्य के सिंहासन पर विराजमान देवी का भी स्मरण किया गया। अपनी इष्टदेवी को संतुष्ट करने के पश्चात, निर्दिष्ट विधि से संतोष अर्पित किया गया। फिर, शस्त्रों के साथ 'मैं संतोष अर्पित करता हूँ' कहते हुए वैनतेय को संतुष्टि दी गई। वैष्णव साधक ने विष्वक्सेन और शैलेय को भी पूर्ण संतोष अर्पित किया। पूजा स्थान में प्रवेश कर, पहले चरण धोए और उन्हें स्पर्श किया। फिर, पूजा-गृह में आकर, द्वार पर ही पूजा संपन्न की। बाईं ओर सरस्वती को और दाईं ओर पुनः गणेश को स्थापित किया। बाईं ओर यमुना, दाईं ओर धाता, और फिर बाईं ओर भी उन्हीं का ध्यान किया गया। इसके पश्चात, विद्वान साधक ने परंपरा के अनुसार द्वारपालों की पूजा की। वैष्णव द्वारपालों में भद्र, सुभद्र आदि का स्मरण हुआ। शैव द्वारपालों में वृषभ और महाकाल का पूजन किया गया। सेन्दु, स्वनाम, अघर्न आदि का भी 'नमः' और 'ॐ' के साथ स्मरण किया गया। तीन प्रकार के—दैविक, दैहिक और भौतिक—विघ्नों को सावधानीपूर्वक दूर किया गया। तत्पश्चात, कीर्ति से युक्त केशव और तेज से युक्त नारायण का भी स्मरण और पूजन किया गया।