જ્ઞાની પુરુષ પોતાના ધ્યાન માટે નાભિની નીચે, ત્રણ આંગળ જેટલી ઊંચાઈએ આવેલા પરમ કમળનું ધ્યાન કરી શકે છે. એ કમળમાં ક્યારેક આઠ પાંખો હોય છે, ક્યારેક પાંચ, અને એ રીતે જ ધ્યાન કરવામાં આવે છે. આ સ્થાનમાં અગ્નિ, ચંદ્ર અને સૂર્યના ત્રિકોણાકાર મંડલનું પણ ધ્યાન કરી શકાય છે—દરેકના પોતાના શક્તિઓ સાથે. સૌપ્રથમ અગ્નિ, પછી સૂર્ય અને પછી ચંદ્ર, આ ક્રમ અનુસાર એને અગ્નિમંડલથી નીચે સ્થિર રાખી, ધર્મ અને અન્ય ચાર પ્રકારના ગુણોના સમૂહનું પણ ધ્યાન કરવું જોઈએ. આ મંડલ ઉપર ત્રણ ગુણોનું ધ્યાન ક્રમશઃ કરવું અને પછી સાધક પોતાને સત્ત્વગુણમાં સ્થિર કરીને, પોતાના શક્તિથી ઘેરાયેલા રુદ્રનું ધ્યાન કરે છે. યોગ્ય રીતે ધ્યાન કરવાનો અભ્યાસ નાભિ પર, કંટક પર, ભ્રૂમધ્યમાં, કપાળના મધ્યમાં અથવા શિખર પર પણ કરી શકાય છે. આગળ, સાધકને ક્રમશઃ દ્વિપત્ર, સોળ-અર, બાર-અર, દસ-અર, છ-કોણ અને ચાર-કોણ જેવા વિવિધ કમળોમાં શિવનું ધ્યાન કરવું જોઈએ. એ કમળ ક્યારેક સુવર્ણ જેવા તેજસ્વી, મહેલ જેવા ભવ્ય, શુદ્ધ સફેદ, બાર સૂર્ય જેટલું તેજ ધરાવતું કે ચંદ્રમંડળ જેવું ઉજ્જવળ હોય શકે છે. ક્યારેક એ વીજળીની ઝલક જેવું પણ લાગે છે—એવી જગ્યાએ પરમેશ્વરનું ધ્યાન કરવું, અથવા વીજળીના વર્તુળ કે અગ્નિ રંગમાં મન એકાગ્ર કરીને ધ્યાન કરવું. ક્યારેક એ જગ્યા હીરાના ટોચ જેવું તેજ ધરાવતી, મુક્તા જેવી લાલિમા ધરાવતી કે વાદળી-લાલ વર્તુળ જેવી હોય છે—તેમાં યોગી ધ્યાન કરે છે. હૃદયમાં મહેશ્વર, નાભિ કમળમાં સદાશિવ, કપાળ પર ચંદ્રશેખર અને ભ્રૂમધ્યમાં શંકરનું ધ્યાન કરવું જોઈએ. દિવ્ય અને શાશ્વત સ્થાને, શુદ્ધ, નિર્વિકાર, પરમ શાંતિમય, જ્ઞાનસ્વરૂપ બ્રહ્મરૂપ શિવનું ધ્યાન કરવું જોઈએ.