एकदा, विधिपूर्वक अर्घ्यपात्र तयार करून, त्यावर पाणी शिंपडावे आणि त्याची पूजा करावी. मग, मनाने आपण कमळावर बसलो आहोत असे ध्यान करावे आणि त्या कमळाच्या बाहेर शिवाला ‘हौं’ मंत्राने स्मरण करावे. यानंतर श्रीवत्स, वास्तुपती, ब्रह्मा, समूह व गुरु यांचे ध्यान करावे. पुढे, अधर्माचा प्रारंभ, अग्निच्या उद्गमस्थानी, मध्यभागी व कमळाच्या गर्भात ध्यान करावे. ‘ॐ हौं’ या मंत्राने शब्दरूप बदलणाऱ्या, शक्तिरूप बदलणाऱ्या तत्त्वाचे पूजन करावे. एकाग्रचित्ताने, या सर्वांचा वेदीच्या मध्यभागी, शिवाच्या सन्मुख पूजन करावे. आवाहन, स्थापना, सन्निधी आणि संनियमन या क्रिया पार पाडाव्यात. मग आचमन, अभ्यंग, उक्षण, स्नान व शुद्धीकरण करावे. पुन्हा आचमन, मुखशुद्धी, तांबूल व हस्तप्रक्षालन करावे. जर प्रतिकात्मक मूर्ती असेल, तर एक दिवसाचा जप व त्या जपाची अर्पण करावी. आग्नेय दिशेपासून विधीची सुरुवात करून, अग्नि, बाणांचा अधिपती, वायव्य दिशेत आणि मध्यभागी यांचे पूजन करावे. मग, ‘हे गुह्यरक्षक आणि सर्वात गूढ असलेले प्रभो, आम्ही केलेला हा जप स्वीकारा’ अशी प्रार्थना करावी. ज्याप्रमाणे कोणतेही कर्म, ते चांगले असो वा वाईट, शिवच त्याचा दाता आहे, शिवच त्याचा भोक्ता आहे, आणि हे संपूर्ण विश्व शिवच आहे. मी जे काही केले, किंवा करणार आहे, ते सर्व शुभ तुझ्या चरणी अर्पण करतो. आता मी दुसऱ्या प्रकारे शिवपूजेचे वर्णन करतो. वायुव्यापी अस्त्र किंवा तुझ्या स्वामीचे, द्वाराशी, आणि पूर्व दिशेपासून आरंभ करून पूजन करावे. प्रकाश, वायू, आकाश, गंध, रस, रूप आणि शब्द यांचे स्मरण करावे. डोळा, जिव्हा, नाक, मन, बुद्धी, अहंकार आणि प्रकृती यांचा विचार करावा. माया, शुद्ध ज्ञान, ईश्वर व सदाशिव यांचे ध्यान करावे. जो शिव आहे, तोच हरि आहे, तोच ब्रह्मा आहे; मीच ते ब्रह्म आहे, हे शंकरा. आता मी पंचतत्त्वशुद्धी सांगतो, ज्यामुळे शिव शुद्ध होतो. पिंगला आणि इडा या दोन नाड्या, प्राण व अपान हे दोन वारे, आणि मुखमार्गाने जाणारा वायू, हे सर्व एकाच गुणधर्माने बाणांसारखे आहेत. ‘ॐ ह्रीं’ या मंत्राने स्थापना, ‘ह्रूं ह्रः फट्’ या मंत्राने, चौर्यासी कोटींचा आधार असलेले पृथ्वी तत्त्व स्मरावे. त्यातच, सृष्टीवृक्ष आणि आत्म्याचे ध्यान करावे. वामादेवी ही स्थापना आहे, सुषुम्ना ही आधार आहे. गुणांचा उत्कर्ष, वेद आणि श्वेत ध्यान यांचे स्मरण करावे. कमळचिन्ह असलेले, बत्तीस कोटींवर पसरलेले कमळ ध्यानात आणावे. तालू आणि कमळाचा प्रदेश, ज्ञानयुक्त अघोर यांचे ध्यान करावे. रुद्राचे कारण, त्रिगुणात्मक, तीनदा उत्कर्ष असलेले, लाल वर्णाचे ध्यान करावे. विस्तार व उत्कर्ष यांचा विचार करून, रुद्रतत्त्वाचे ध्यान करावे. कासव, मगर, वायू, देव आणि प्रभूचे कारण यांचे स्मरण करावे. बिंदूने चिन्हांकित, आठ कोटींवर पसरलेले आणि उत्कर्ष असलेले ध्यान करावे. बारा पाकळ्यांचे कमळ, शांततेला मागे टाकणारे प्रभू यांचे स्मरण करावे. शिखरावरचे कारण व ईशान, हे सदाशिव म्हणून स्मरण करावे. सोळा कोटींवर पसरलेले, पंचवीस उत्कर्ष असलेले ध्यान करावे. गुणांचा गुरु, बीजगुरु, शक्तिपंथ आणि धर्मात्मा यांचे स्मरण करावे. वर आणि खाली दोन तोंड असलेले, कमळाचा गर्भ व तंतू यांचे ध्यान करावे. शिवासनावरील तत्त्व, त्याचे रूप, ‘ही हौं’ मंत्राने, ज्ञानस्वरूप देहाला नमस्कार करावा. अशा प्रकारे, या विधिपूर्वक शिवपूजा आणि तत्त्वशुद्धीचे वर्णन संहितेने सांगितले आहे.