गुरु याज्ञवल्क्य द्वारा वनवासी और संन्यासी के कर्तव्यों का विस्तारपूर्वक वर्णन समाप्त होते ही, गरुड़ महापुराण के अगले अध्याय में पापों के फल और उनके प्रायश्चित्त का गूढ़ विवेचन आरंभ होता है। वर्णन आता है कि नरक के ध्वज से पापों का नाश होता है। जो सोना चुराता है, वह अगले जन्म में कीट या कीड़ा बनता है; और जो गुरु की पत्नी का उल्लंघन करता है, वह घास या इसी प्रकार के निम्न योनि में जन्म लेता है। यदि कोई ब्राह्मण की हत्या करता है, तो उसके भीषण परिणाम होते हैं—यह सब फल एक बालक को भी भुगतने पड़ सकते हैं। जो अन्न चुराता है, जिसके शरीर में अतिरिक्त अंग हैं, जो दूसरों की निंदा करता है या जिसकी नाक से दुर्गंध आती है, उसे भी दंड भुगतना पड़ता है। जो ब्राह्मण की संपत्ति चुराता है या कन्या का क्रय करता है, वह वन में राक्षस या बैल बनता है। जो ककड़ी की फली चुराता है, वह अगले जन्म में खेतों में अनाज चुराने वाला चूहा बनता है। मांस चुराने वाला गिद्ध बनता है; कपड़ा चुराने वाला कोढ़ी; और नमक चुराने वाला तीतर बनता है। जिनमें शुभ लक्षण नहीं होते, वे निर्धन और नीच कुल में जन्म लेते हैं; और जिनमें शुभ लक्षण होते हैं, वे धन-धान्य से संपन्न घर में जन्म पाते हैं। इसके बाद, याज्ञवल्क्य प्रायश्चित्त के विषय में कहते हैं कि यदि कोई अपने कर्तव्यों का पालन नहीं करता या निषिद्ध कर्म करता है, तो उसे शुद्धि के लिए अवश्य प्रायश्चित्त करना चाहिए। प्रायश्चित्त करने से संसार प्रसन्न होता है और पाप नष्ट हो जाते हैं। पापी व्यक्ति महा-रौरव, रौरव आदि भयानक नरकों में जाते हैं। उनका मार्ग संजीवनी नामक नदी की ओर जाता है, जिसकी जलधारा हंस के समान और लाल रंग की होती है। जो पुण्यहीन होते हैं, वे अवीचि और कुम्भीपाक जैसे नरकों में गिरते हैं। गुरु या वेद की निंदा करना ब्रह्महत्या के समान पाप माना गया है। मासिक धर्मवती स्त्री के मुख का स्पर्श करना मद्यपान के तुल्य है। मित्र की पत्नी, कन्या, अपनी ही जाति की स्त्री या पतित स्त्रियों के साथ संबंध बनाना, पिता की बहन, माता की बहन, मामा की पत्नी या अपनी पुत्रवधू के साथ संबंध, गुरु-पत्नी या अपनी पुत्री के साथ संपर्क—इन सबको गुरुस्त्रीगमन कहा गया है, जो घोर पाप है। गाय की हत्या, पतित होना, चोरी करना, ऋण न चुकाना, सेवक से शिक्षा लेना या धन के लिए पढ़ाना, अशुद्ध मार्ग से जीवन-यापन करना, पिता-माता या मित्र का त्याग करना, तालाब या बगीचा बेचना, कन्या का अनुचित दान, कपट करना, व्रत तोड़ना, अपने अध्ययन, अग्नि या संबंधियों का त्याग करना—ये सब उपपातक (छोटे पाप) माने गए हैं। अब इनके प्रायश्चित्त का वर्णन आता है। ब्रह्महत्या करने वाला ब्राह्मण बारह वर्ष तक अल्पाहार करके शुद्ध होता है। या वह उचित मंत्रों के साथ मज्जा में आहुति दे, अथवा ब्राह्मण के लिए मारा जाए, तब भी वह या द्विज गाय क्लेश से मुक्त हो जाते हैं। अथवा सरस्वती की सेवा या योग्य पात्र को धन दान करने से भी पाप का क्षय होता है। गर्भ का नाश करने वाला अपने वर्ग के अनुसार आत्रेय को नियत दक्षिणा दे। सोमयज्ञ में उपस्थित ब्राह्मण को दुगुना कठोर व्रत करना चाहिए—वह वल्कल वस्त्र और जटा धारण करे, और अग्निवर्ण घृत का ही आहार करे। ब्राह्मण स्त्री यदि वीर्य, मूत्र, विष्ठा या मद्य का पान करे, तो उसके लिए भी यही नियम है। द्विज यदि सोना चुराए, तो वह राजा को मूस दान करे या अपने वजन के बराबर सोना दान कर शुद्ध हो। और, जो पुरुष का अंग कट गया हो, उसके लिंग और वृषणों को दक्षिण-पश्चिम दिशा में फेंक देना चाहिए। इस प्रकार, गरुड़ महापुराण में याज्ञवल्क्य ने पापों के भयंकर फल और उनके प्रायश्चित्त का विस्तारपूर्वक वर्णन किया, जिससे मनुष्य अपने कर्मों के प्रति जागरूक हो और धर्ममार्ग पर चले।