आचार्य विधिपूर्वक यज्ञ की तैयारी करता है। सबसे पहले वह ‘ओषधि’ मंत्र से कलश का शुद्धिकरण करता है। फिर समुद्र के जल से अभिषेक कर, पुनः अर्घ्य अर्पित करता है। अपनी शास्त्रानुसार प्राप्त वस्त्रों को लेकर, ‘तुम युवा हो’ ऐसा कहते हुए, वह ‘शंभु’ मंत्र से वे वस्त्र शय्या पर सजाता है। फिर सर्वोच्च तत्त्व में स्थित होकर, मंत्रों की स्थापना करता है। इसके बाद वह मूर्ति को वस्त्र से ढँककर, स्वाभाविक रूप से उसकी पूजा करता है। अब, ओंकार के साथ दो वस्त्रों में मूर्ति को लपेटता है। वेदी के समीप खड़े होकर, अग्नि की स्थापना करता है। फिर वह श्रीसूक्त, पावमानीय, वासदाम्य और असवजिन स्तोत्रों का पाठ करता है; रुद्र, पुरुषसूक्त और शुक्रीय मंत्रों के अध्यायों का भी उच्चारण करता है। वैदिक व्रत, वामदेव, ज्येष्ठसामन और रथंतर का भी पाठ करता है। इसके साथ ही अथर्वशीर्ष और अथर्ववेद के कुम्भसूक्त का भी पाठ करता है। आचार्य विशेष रूप से आयुध-मंत्र से वेदी का छिड़काव करता है। फिर जातवेदस अग्नि को प्रकट कर, उसे आगे स्थापित करता है। इसके बाद, सभी मंत्रों के साथ उसे अमृत के समान बनाता है और वैष्णव योग-पद्धति से परम तेज प्रकट करता है। अपने परंपरागत या सामान्य मंत्र से—ब्रह्मा, विष्णु, हर, और ईशान—इन सबकी पूजा सामान्य मंत्र से करता है। यदि किसी के पास मंत्र न हो, तो वह कुश और जल के स्पर्श से भी शुद्ध हो जाता है। जब अग्नि के चारों ओर कुश बिछा दी जाती है, तब अग्नि स्वयं प्रकट होती है। कुछ आचार्य जन्मादि संस्कार के तुरंत बाद ही इसे कर लेना चाहते हैं। फिर आचार्य घृत को मंत्रों से संस्कारित करता है। इसके बाद, पाँच-पाँच की पाँच आहुतियाँ घृत से अर्पित करता है, अपने शास्त्रानुसार मंत्रों और ओंकार के साथ यह हवि अर्पित करता है। इस प्रकार उत्पन्न अग्नि सभी कर्मों में सफलता देती है। इन्द्र आदि देवताओं को उनके-अपने मंत्रों से सौ-सौ आहुतियाँ देता है। फिर आचार्य अपने लिए भी घृत की आहुति उसी पात्र में रखता है। एकाग्रचित्त होकर, वह सम्पूर्ण आहुति अर्पित करता है—यह प्राणियों, देवताओं और नागों के लिए विधिपूर्वक की जाती है। घृत दोनों के लिए सहायक है, और अपने-अपने पात्र में वह प्रधान है। ज्येष्ठसामन और भारुंड मंत्रों को पश्चिम दिशा में ले जाया जाता है। प्रत्येक देवता को हजार आहुतियाँ देकर, उन्हें सिर पर स्थापित करता है। वह सिर के स्थानों पर आहुतियाँ अर्पित करता है और क्रमशः उनमें प्रविष्ट होता है। हे द्विजों, वह अपने शास्त्रानुसार या गायत्री मंत्र से भी यह कर सकता है। इस प्रकार आहुति की विधि पूर्ण कर, आचार्य मंत्रों की स्थापना करता है—‘अग्नि, आओ!’ दोनों जंघाओं पर; ‘देवता हमें कल्याण दें’—घुटनों पर; ‘दीर्घायु हो’—हृदय पर; ‘तेजस्वी बनो’—कंठ पर; ‘मस्तक बनो’—मस्तक पर। इनकी स्थापना के बाद, वह होम करता है। ‘वेद’ और ‘शुभ दिवस’ कहते हुए, वह मंदिरों की परिक्रमा करता है। दिशाओं के रक्षकों का, रत्नों, धातुओं और औषधियों के साथ भी सम्मान करता है।