संपूर्ण विधी अत्यंत श्रद्धेने आणि नियमपूर्वक सुरू होते. प्रथम, एक पवित्र शिला चंदनाने अभिषेक करून, ती शुभ वस्त्रांनी झाकली जाते. तिच्यासाठी सुवर्णाचे आसन अर्पण केले जाते आणि मग ती शिला यज्ञस्थळी दक्षिणावर्त म्हणजेच उजवीकडून प्रदक्षिणा घालत नेली जाते. यानंतर, त्या शिलेला हृदयभागाने कुशांच्या पलंगावर किंवा आसनावर ठेवले जाते. तिची विधिपूर्वक पूजा केली जाते आणि विवेकपूर्वक, पृथ्वीपासून सर्वोच्च तत्त्वापर्यंत सर्व तत्त्वांची मांडणी केली जाते. तीन विभागांमध्ये व्यापणाऱ्या त्रैगुण्य तत्त्वांचे, बुद्धीपासून मनापर्यंत, विचार आणि सूक्ष्म तत्त्वांच्या मर्यादेत अनुक्रमाने स्थान दिले जाते. सूक्ष्म तत्त्वापासून पृथ्वीपर्यंत, ज्यांची स्वभावतः शिवज्ञान आहे, अशा तत्त्वांची आणि त्यांच्या अधिपतींची हृदयात स्वतःच्या मंत्रांनी पूजा केली जाते. पुष्पमाळा आणि इतर चिन्हांनी सुशोभित केलेल्या ठिकाणी योग्य क्रमाने, "ॐ हूं, शिवतत्त्वास नमस्कार; ॐ हूं, रुद्र, शिवतत्त्वाचे अधिपती; ॐ हां, ज्ञानतत्त्वास नमस्कार; ॐ हां, विष्णु, ज्ञानतत्त्वाचे अधिपती; ॐ हां, आत्मतत्त्वास नमस्कार; ॐ हां, ब्रह्मा, आत्मतत्त्वाचे अधिपती"—अशा मंत्रांनी पूजा केली जाते. यानंतर पृथ्वी, अग्नी, यजमान, सूर्य, जल, वायु, चंद्र इत्यादींची पूजा केली जाते. प्रत्येक तत्त्वासाठी, प्रत्येक शिलेमध्ये आठ रूपांची स्थापना केली जाते; ती सर्व पाशुपती, उग्र रुद्र, भव आणि ईश्वर आहेत. महादेव आणि भीम, तसेच रूपांच्या अंशांची योग्य क्रमाने, "ॐ, पृथ्वीच्या रूपास नमस्कार; ॐ, पृथ्वीच्या अधिपतीस नमस्कार"—अशा मंत्रांनी, जगाच्या संरक्षकांची स्वतःच्या बीजाक्षरांनी पूजा करावी. त्यांची स्थापना केल्यावर, त्या कलशांचीही त्या मंत्रांनी किंवा स्वतःच्या अक्षरांनी पूजा करावी. इंद्र व इतरांच्या बीजाक्षरांची योग्य क्रमाने मांडणी करावी: "लूं, रूं, शूं, पूं, वूं, यूं, मूं, हूं, क्षूं"—अशा नवशिलांची रचना होते; शिला पाच प्रकारचीही असते. प्रत्येक तत्त्वासाठी, सृष्टीमध्ये पाच रूपांची मांडणी करावी, पृथ्वीपासून सुरुवात करावी. ब्रह्मा, विष्णु, रुद्र, ईश्वर आणि सदाशिव—ही पाच रूपाधिपती पूर्वीप्रमाणे त्या ठिकाणी पूजावी. "ॐ, पृथ्वीच्या रूपास नमस्कार; ॐ, ब्रह्मा, पृथ्वीच्या रूपाधिपतीस नमस्कार"—अशा मंत्रांनी, पाचही कलशांची त्यांच्या नावाने पूजा करावी आणि मध्यशिलापासून प्रारंभ करून योग्य पद्धतीने त्यांना संहित करावे. मंत्राने, कुशा आणि तीळ वापरून सीमा आखावी; मग अग्निकुंडात शक्ती स्थानापन्न करून पूजा व होम करावा. तत्त्वांच्या रूपांची आणि त्यांच्या अधिपतींची तुप व इतर नैवेद्यांनी पूजा करावी; मग ब्रह्मा-अंशाच्या शुद्धीसाठी, मूळ व अंगांची ब्रह्मा-मंत्रांनी अनुक्रमे प्राणप्रतिष्ठा करावी. शंभर किंवा त्याहून अधिक शिला पूर्ण भरल्यानंतर, शांतीसाठी त्यांच्यावर जलसिंचन करावे; मग कुशाने स्पर्श करून, प्रत्येक तत्त्वाची अनुक्रमे पूजा करावी. उपस्थापन व संबंध प्रस्थापित करून, पुन्हा शुद्धी व प्रतिष्ठा करावी; अशा प्रकारे तीन विभागांतून हा विधी वारंवार पार पाडावा. "ॐ आं ईं, आत्मतत्त्व व ज्ञानतत्त्वास नमस्कार." अशा मंत्रांनी, तिन्ही ब्रह्मा-अंगांना दर्भाच्या मूळांनी स्पर्श करावा आणि तत्त्वांचे चिंतन अल्प व दीर्घ पद्धतीने करावे. "ॐ हां उम्, ज्ञान व शिवतत्त्वास नमस्कार." अशा मंत्रांनी, तुप व मध घालून रत्नांनी अलंकृत तांब्याच्या कलशात भरावे. जगाच्या पालक दैवतांवर पंचगव्य आणि अर्घ्य अर्पण करून, त्यांना स्नान घालावे. स्वतःच्या मंत्रांनी पूजा करून, त्यांच्या समोर होम करावा. मग सर्व शिलांसाठी, त्यांच्या अधिष्ठाता दैवतांचे—जी ज्ञानरूप, सुवर्णवर्णी, रत्नांनी भूषित व स्नान केलेली आहेत—स्मरण करावे, जेणेकरून कोणतीही त्रुटी, दोष किंवा अतीरेक दूर होईल आणि भूमीची शुद्धी साधता येईल. यानंतर, ईश्वर म्हणतात: "मंदिराचे माप घेऊन, मुख्य सभागृह आणि अंतराळ चिन्हांकित करावे. चौसष्ट कोठारांची रचना करावी आणि वेदी समप्रमाणात ठेवावी." कोपऱ्यांत स्तंभ उभारावेत आणि आठ दोरांनी तिरप्या कोपऱ्यांपर्यंत मांडणी करावी; तेथे द्विपाद व षट्पाद जीवांची नियमपूर्वक पूजा करावी. वास्तुपुरुषाचा, केस वर बांधलेला, राक्षसाच्या रूपात उत्तराभिमुख पडलेला आहे, असा स्मरण करावा—भिंती व इतर बांधकाम करताना आणि पूजेतही. त्याची गुडघी व कोपर वायू व अग्नीच्या दिशांना, पितृदिशेला तळवे, उग्रदिशेला डोके आणि हृदयात जोडलेली करांगळी असते. त्याच्या शरीरावर, पूर्वी पूजित केलेली शुभ दैवते प्रतिष्ठित असतात; तिथे आठ कोपऱ्यांचे अधिपती आठ अर्धकोपऱ्यांत विराजमान असतात. षट्पाद, मरीचिपासून सुरू होऊन, पूर्व दिशेपासून अनुक्रमे असतात; मध्यभागी चतुर्पाद ब्रह्मा असतो, आणि उरलेले एकपाद म्हणून ओळखले जातात. सर्व नाड्या जिथे एकत्र येतात, तोच महत्त्वाचा प्राणबिंदू असतो, जो स्वतःचे फल देतो; तेथे त्रिशूल, स्वस्तिक, वज्र आणि मोठा स्वस्तिक यांचा वेढा असतो. त्रिशिखर, मनिबंध, आणि पूर्णपणे शुद्ध असा बिंदू—अशा बारा प्राणबिंदू भिंती व इतर भागांत टाळावे. ईशास तुप व अक्षत अर्पण करावे, पर्जन्याला कमळजल, आणि जयंताला तेजस्वी केशराचा ध्वज अर्पण करावा. महेंद्राला रत्नजल, सूर्याला करड्या रंगाचा छत्र, सत्य आणि भृष यांना तुप, गहू व पिठाचे पिठले अर्पण करावे. अंतरिक्षाला कच्चे मांस, शक्तीला शस्त्र, आणि पूर्व दिशेला अग्नीस मध, दूध, दही व तुपाने भरलेली समिधा अर्पण करावी. वितथाला भाजलेला तांदूळ व सोन्यात शुद्ध जल; गृहपालाला मध; यमराजाला डाळी घालून शिजवलेला भात अर्पण करावा. गंधर्वाधिपतीस गंध, भृंगास पक्ष्याची जीभ, हरणास कमळपर्ण, आणि दक्षिण दिशेतील आठ दैवतांना अशा प्रकारे अर्पण करावे. पितरांना तिळाचे जल, दूध आणि दात घासण्याची काडी अर्पण करावी; द्वारपालाला छाप असलेली गाय अर्पण करावी. सुग्रीवास केक, पुष्पदंतास कुशा, प्रचेतास लाल कमळ, असुरास मद्य अर्पण करावे. शेषास तुप व गुळभात, रोगांना तुपाचे केक किंवा पश्चिम दिशेला भाजलेला तांदूळ, आठ दैवतांसाठी सांगितल्याप्रमाणे अर्पण करावे. मारुतास पिवळा ध्वज, नागास नागकेशर फुले, भल्लाट प्रमुखास उत्तम डाळीचे पाणी व इतर अन्न अर्पण करावे. सोमास तुप घालून दूधभात, शालुक व मूषासही तसाच; लोपि, मदिति, दिति यांना उत्तरेच्या अष्टकोणात नगर अर्पण करावे. पूर्वेकडील ब्रह्म्यास गोड केक, मरीचिस सहापद फुल, सवित्रास लाल फुले, अग्निकोनातील कक्षात अर्पण करावी. त्याखालील कक्षात सावित्रिला कुशाजल अर्पण करावे; दक्षिण बाजूस, सहापदी आसनस्थ विवस्वतास लाल चंदन अर्पण करावे. इंद्राला, राक्षसकोनाखालील कक्षात, हळद घालून शिजवलेला भात अर्पण करावा; इंद्रजयास, इंद्राखालील कक्षात, मिश्र अन्न नैवेद्य म्हणून द्यावे. अशा प्रकारे, प्रत्येक विधी, प्रत्येक दैवत व तत्त्व यथायोग्य पूजिले जाते, आणि मंदिराच्या भूमीपासून ते तत्त्वांच्या सूक्ष्म प्रतिष्ठेपर्यंत, संपूर्ण विधी भक्तिभावाने आणि शास्त्रानुसार पार पाडला जातो.