ശുദ്ധീകരണത്തിന് ശേഷം, ആചാരപ്രകാരം ആദ്യം തത്വം നിശ്ചയിക്കണം. അതിനുശേഷം കൈകൾ ശുദ്ധീകരിച്ച് ആസ്ത്രമുദ്ര നിർവ്വഹിക്കണം; വലത് അങ്കുഷ്ഠത്തിൽനിന്ന് ആരംഭിച്ച് കൈകളിൽ ആവിഷ്കരണം നടത്തണം. അതിനുശേഷം ഹൃദയം, ശിരഃ, ശിഖ, കവചം, ആയുധങ്ങൾ, കണ്ണുകൾ—ഇവയെല്ലാം, ആറു ദ്വന്ദ്വങ്ങളായി, ശരീരത്തിലെ മൂലവും പന്ത്രണ്ടു അംഗങ്ങളും മന്ത്രങ്ങളാൽ നിശ്ചയിക്കണം. അനന്തരം, ഉദരം, പുറം, ഭുജങ്ങൾ, മുട്ടുകൾ, പാദങ്ങൾ എന്നിവ ക്രമത്തിൽ സ്പർശിച്ച്, മുദ്ര നിർമ്മിച്ച്, വിഷ്ണുവിനെ സ്മരിച്ച്, അഷ്ടക്ഷരമന്ത്രം ജപിച്ച്, അർച്ചന നടത്തണം. വർദ്ധനീ (വൃദ്ധി നൽകുന്ന ഉപകരണം) ഇടതുവശത്തും, പൂജാസാമഗ്രികൾ വലതുവശത്തും വച്ച്, ആയുധമന്ത്രം, സുഗന്ധം, പുഷ്പം ചേർത്ത അർഘ്യജലം ഉപയോഗിച്ച് അവയെ ശുദ്ധീകരിച്ച് വയ്ക്കണം. അഷ്ടപദജപത്താൽ ശക്തിയാർജിതമായ ജലം, കൂടാതെ 'ഫട്ട്' എന്നാക്ഷരവും ചേർത്ത്, സാമഗ്രികൾക്ക് അഭിഷേകം നടത്തണം. കൈയിൽ പരമഹരിയെ, സർവ്വവ്യാപിയായ ചൈതന്യവും പ്രകാശവും ആലോചിക്കണം. അഗ്നി മുതലായ ദിശകളിൽ ധർമ്മം, ജ്ഞാനം, വൈരാഗ്യം, ഐശ്വര്യം എന്നിവയും, യോഗാസനത്തിൽ കിഴക്കൻ ദിശ മുതൽ അശുഭങ്ങൾ ശരീരത്തിലെ അങ്കങ്ങളിൽ നിശ്ചയിക്കണം. ആസനത്തിൽ, കച്ചുവ, അനന്തൻ, യമൻ, സൂര്യാദി ചക്രങ്ങൾ, വിശുദ്ധന്മാർ, മറ്റു ദേവതകൾ, ദിശാരക്ഷകർ, പുഷ്പദളങ്ങളിലെ അനുഗ്രഹദേവതകൾ എന്നിവയെ മനസ്സിൽ പ്രതിഷ്ഠിക്കണം. ആദ്യം ഹൃദയത്തിൽ ധ്യാനം ചെയ്ത്, പിന്നീട് മണ്ഡലത്തിൽ ആഹ്വാനം ചെയ്ത്, അർഘ്യം, പാദ്യജലം, ആചമനജലം, മധുപർക എന്നിവ അർപ്പിക്കണം. പിന്നെയും അതേ ക്രമത്തിൽ അർപ്പിക്കാം. സ്നാനം, വസ്ത്രം, യജ്ഞോപവീതം, അലങ്കാരങ്ങൾ, ഗന്ധം, പുഷ്പം, ധൂപം, ദീപം, ഭോജനനൈവേദ്യം—ഇവയെല്ലാം പുണ്ഡരികാക്ഷമന്ത്രം ഉപയോഗിച്ച് സമർപ്പിക്കണം. കിഴക്കു തുടങ്ങി ദിശകളിൽ അങ്കങ്ങൾ പൂജിക്കണം; കിഴക്കൻ വാതിലിൽ ഗരുഡപതിയെ, തെക്കോട്ട് ചക്രം, ഈശാന്യത്തിൽ ഗദ, വാമദിശയിൽ ശംഖവും ധനുസും വയ്ക്കണം. പ്രതിമയുടെ വലതുവശത്ത് ബാണവും ഖഡ്ഗവും, ഇടതുവശത്ത് കവചം, ശ്രീ, പുഷ്ടി എന്നിവ ഇടതുവശത്തുനിന്ന് മുന്നിൽ വയ്ക്കണം. വനമാല, ശ്രീവത്സ, കൗസ്തുഭം, ദിശാരക്ഷകർ എന്നിവയെ അവരവരുടെ മന്ത്രങ്ങളാൽ, അന്ത്യത്തിൽ വിഷ്ണുവിന് അർഘ്യം അർപ്പിച്ച്, പൂജിക്കണം. അംഗങ്ങൾ വേർതിരിച്ചോ ഒന്നിച്ചോ ബീജമന്ത്രങ്ങളാൽ പൂജിക്കണം; മന്ത്രം ജപിച്ചശേഷം പ്രദക്ഷിണം, സ്തുതി, അർഘ്യസമർപ്പണം നടത്തണം. ഹൃദയത്തിൽ ധ്യാനം ചെയ്ത്, 'ഞാൻ ബ്രഹ്മാവാണ്, നീ ഹരിയാണ്' എന്ന ഭാവം സ്ഥാപിക്കണം. ആഹ്വാനത്തിൽ 'വരിക' എന്നും, ഉത്സർജ്ജനത്തിൽ 'ക്ഷമിക്കണം' എന്നും പറക. ഇങ്ങനെ അഷ്ടക്ഷരമന്ത്രം മുതലായ മന്ത്രങ്ങളാൽ പൂജനിർവ്വഹിച്ചാൽ മോക്ഷം ലഭിക്കും. ഏകരൂപപൂജയുടെ വിധി ഇതാണ്; ഇനി നവവ്യൂഹപൂജയുടെ ക്രമം കേൾക്കൂ. വാസുദേവൻ തുടങ്ങിയവരെ രണ്ട് അങ്കുഷ്ഠങ്ങളിൽ, പിന്നെ ചൂണ്ടുവിരൽ മുതലായവയിൽ, ശരീരത്തിൽ, തലയിൽ, നെറ്റിയിൽ, മുഖത്തിൽ പൂജിക്കണം. ഹൃദയം, നാഭി, ഗുഹ്യം, മുട്ടുകൾ, പാദങ്ങൾ എന്നിവ കിഴക്കു തുടങ്ങി നടുവിൽ പൂജിക്കണം; ഏകാസനം, നവവ്യൂഹങ്ങൾ, നവാസനങ്ങൾ മുൻപത്തെപോലെ സ്ഥാപിക്കണം. ഒമ്പതു ദളങ്ങളിൽ, ഒമ്പതാം രൂപത്തിലും, നവവ്യൂഹങ്ങളിലും, വാസുദേവനെ നടുവിൽ പൂജിക്കണം. നാരദൻ പറഞ്ഞു: എല്ലാ മനസ്സിലുണ്ടാകുന്ന കാര്യങ്ങളും ലഭിക്കാൻ അഗ്നികാര്യവിധി ഞാൻ വിശദീകരിക്കാം. അഗ്നികാര്യസ്ഥലം ചതുരസ്രവും ഇരുപത്തിനാലു വിരൽ നീളവും നാലു വിരൽ വീതിയുമുള്ളതും ആകണം. കയർ ഉപയോഗിച്ച് അതിന്റെ പരിധി നിർണ്ണയിച്ച്, അത്രയോളം മണ്ണ് അഴുകണം. നാരദൻ വീണ്ടും ചോദിച്ചു: വാസുദേവൻ, സങ്കർഷണൻ, പ്രദ്യുമ്നൻ, അനിരുദ്ധൻ എന്നിവരുടെ മന്ത്രങ്ങളാൽ പൂജിക്കേണ്ട ദേവതകളുടെ സ്വഭാവങ്ങൾ വിശദീകരിക്കൂ. ആദിയിൽ ഭഗവാനെ നമസ്കരിക്കണം; അ, ആ, അം, അഃ എന്ന ബീജാക്ഷരങ്ങൾക്കും, ഒം മുതൽ നമഃവരെ തുടങ്ങുന്നവർക്കും, നാരായണനേയും നമസ്കരിക്കണം. 'ഓം', 'തത്', 'സത്', ബ്രഹ്മാവിനെയും, 'ഓം', വിഷ്ണുവിനെ നമസ്കരിക്കണം; 'ഓം, ക്ഷോം, ഓം', ഭഗവാൻ നരസിംഹനേയും, 'നമഃ' എന്നുമാണ്. 'ഓം ഭൂഃ', ഭഗവാൻ വരാഹനേയും നമസ്കരിക്കണം; ഈ രൂപങ്ങൾ വേഗതയുള്ളതും, ചുവപ്പും, മഞ്ഞയും, നീലയും, കറുപ്പും, ചുവപ്പുമാണ്. മേഘവർണ്ണം, അഗ്നിവർണ്ണം, തേൻപോലെയുള്ള സ്വർണ്ണവർണ്ണം, പ്രിയം, ഒമ്പതു നേതാക്കന്മാർ; സ്വരബീജങ്ങൾ, അവയുടെ പേരുകൾ ക്രമത്തിൽ അങ്കങ്ങളിൽ. ഹൃദയാദികൾ, തന്ത്രം അറിയുന്നവർ വിഭജിച്ചവ, വ്യഞ്ജനബീജങ്ങൾ ഭിന്നസ്വരൂപമുള്ളവയാണ്. 'നമഃ'യിൽ അവസാനിക്കുന്നവ, ദീർഘസ്വരങ്ങൾ ചേർന്നവ അങ്കങ്ങൾ; ഹ്രസ്വസ്വരങ്ങൾ ചേർന്നവ ഉപാങ്കങ്ങൾ. വിഭജിച്ച പേരുകളും അക്ഷരങ്ങളും അവസാനിക്കുന്നവ ഉത്തമം; ദീർഘഹ്രസ്വസ്വരങ്ങൾ ചേർത്ത് മുഖ്യ-ഉപാങ്കങ്ങൾ ക്രമത്തിൽ. ഹൃദയാദികളുടെ സ്ഥാപനം ഈ ക്രമത്തിൽ; അവയുടെ ബീജങ്ങൾ, പേരുകൾ, മുഖ്യ-ഉപാങ്കങ്ങൾ ചേർത്ത്. ഹൃദയാദികൾ, പന്ത്രണ്ടു അന്ത്യങ്ങൾ, അഞ്ചു അങ്കങ്ങൾ ചേർത്ത് സ്ഥാപിച്ച്, ആവിഷ്ടമായ ഫലത്തിന് ജപിക്കണം. ഹൃദയം, ശിരഃ, ശിഖ, കവചം, നേത്രം, കിരീടം—ഇവയാണ് ബീജമന്ത്രങ്ങളുടെ ആറു അങ്കങ്ങൾ; മൂലത്തിന് പന്ത്രണ്ടു അങ്കങ്ങൾ. ഹൃദയം, ശിരഃ, ശിഖ, കവചം, ആയുധം, നേത്രം, ഉദരം, പുറം, ഭുജങ്ങൾ, ഉരങ്ങൾ, മുട്ടുകൾ, പിണ്ഡങ്ങൾ, പാദങ്ങൾ—ഇവ ക്രമത്തിൽ സ്ഥാപിക്കണം. 'കം, ടം, പം, ശം'—വൈനതേയൻ; 'ഖം, ഠം, ഫം, ഷം'—ഗദാമന്ത്രം; 'ഗം, ഡം, ബം, സം'—ബലമന്ത്രം; 'ഘം, ഢം, ഭം, ഹം'—ശ്രീയെ നമസ്കരിക്കുക. 'വം, ശം, മം, ക്ഷം'—പാഞ്ചജന്യൻ; 'ഛം, തം, പം'—കൗസ്തുഭം; 'ജം, ഖം, വം'—സുദർശനം; 'സം, വം, ദം, ചം, ലം'—ശ്രീവത്സം. 'ഓം, ധം, വം'—വനമാലയ്ക്ക്; മഹാനന്തനേയ്ക്ക് നമസ്കാരം; ബീജമില്ലാത്ത മന്ത്രങ്ങൾക്ക് അങ്കങ്ങൾ വാക്കുകളിൽ നിർമ്മിക്കണം. അവയുടെ പേരുകൾ അവസാനിക്കുന്നതിൽ ഹൃദയാദികൾ അഞ്ചുവിധം; പ്രണവം ചേർത്ത്, ഹൃദയാദികൾ അഞ്ചായി പറയുന്നു. ആദിയിൽ പ്രണവം ഹൃദയം, പരാ ശിരഃ, ശിഖ; കവചം സ്വന്തം പേരിൽ, ആയുധം പേരിന്റെ അവസാനം. ഓം, പരാ, ആയുധം, സ്വന്തം പേര്, ചതുര്ഥീവിഭക്തി, നമഃ ചേർത്ത്; ഏകവ്യൂഹം മുതൽ ദശവ്യൂഹം വരെ തന്റെ മന്ത്രം. ചെറിയ വിരലിലും കൈയുടെ അഗ്രങ്ങളിലും ശരീരസ്വഭാവം പൂജിക്കണം; പരാ പുരുഷന്റെ ആത്മാവാണ്, സ്വഭാവത്തിൽ ഇരട്ടമാണ്. ഓം, പരമത്തിനും, അഗ്നിയെ ആത്മാവായും, വായുവിനും സൂര്യനും, ഇരട്ടസ്വരൂപികൾക്കുമാണ്; അഗ്നിയെ ത്രിവിധവും സർവ്വവ്യാപിയുമായവനായി കൈയിലും ശരീരത്തിലും സ്ഥാപിക്കണം. വായുവും സൂര്യനും കൈകളുടെ ശാഖകളിൽ, വലതും ഇടതും കൈകളിലും; രൂപം ഹൃദയത്തിലും ശരീരത്തിലും, ത്രിരൂപത്തിലും നാലാം രൂപത്തിലും സ്ഥാപിക്കണം. ഇങ്ങനെ ആചാരപ്രകാരം പൂജാക്രമം നിർവ്വഹിക്കുമ്പോൾ, വിശുദ്ധതയും, ക്രമവും, മന്ത്രശക്തിയും ചേർന്ന്, ഭഗവാൻ വിഷ്ണുവിന്റെ അനുഗ്രഹം ലഭിക്കുകയും, പരമോന്നത ലക്ഷ്യമായ മോക്ഷം സിദ്ധിക്കുകയും ചെയ്യും.