आचार्य ने जब यज्ञ की विधि आरंभ की, तब सबसे पहले उन्होंने शैव आदेश का उच्चारण किया। इसके बाद वे अपने हाथों में चमचे और स्रुचि (चम्मच और करछुल) लेकर, एक का मुख ऊपर और दूसरे का मुख नीचे रखते हुए, क्रम से उन्हें अग्नि में तापित करते हैं। फिर वे उन तप्त पात्रों को लेकर कुशा घास की जड़, मध्य और अग्रभाग को छूते हैं, और जिस स्थान को स्पर्श करते हैं, वहीं आत्मज्ञान और शिवस्वरूप का आवाहन करते हैं। इसके पश्चात वे तीन तत्त्वों को क्रम से स्थापित करते हैं, और ‘हां, हीं, हूं, सं, र’ इन बीजाक्षरों के साथ चमचे में हृदय-अणु को स्थापित कर शंभु की शक्ति का स्तवन करते हैं। फिर वे उन दोनों पात्रों को, जिनकी गर्दनें तीन सूत्रों से बंधी हैं, फूलों आदि से पूजित कर, अपने दाएँ, कुशा घास के ऊपर रखते हैं। अब वे गाय के शुद्ध किए गए घृत को लेते हैं, और उसे ग्रहण करते समय अपने को ब्रह्मस्वरूप मानते हैं। इस घृत को वे वेदी के ऊपर, हृदय के स्तर पर, अग्नि के क्षेत्र में घुमाते हैं, और पुनः विष्णु के रूप का ध्यान कर, उस घृत को ईशान के क्षेत्र में स्थापित करते हैं। इसके बाद, वे कुशा घास के अग्रभाग से थोड़ा घृत लेकर, ‘स्वाहा’ उच्चारण के साथ सिर को हल्का झुकाते हुए, एक बूँद विष्णु को अर्पित करते हैं, और तुरंत बाद रुद्र को भी। स्वयं का ध्यान करते हुए, घृत को नाभि के पास रखते हैं, और अँगूठे व अनामिका के अग्रभाग से, एक विंग लंबी कुशा घास लेकर, उसे अग्नि के सामने दोनों हाथों से थामते हुए, शस्त्र-मुद्रा में तैराते हैं। फिर, हृदय और आत्मा की ओर मुख करके भी यही तैराने की क्रिया दोहराते हैं। फिर वे हृदय पर जली हुई कुशा घास को शस्त्र-मंत्र से अग्नि में डालते हैं, और दूसरी जलती हुई कुशा से वेदी को झाड़ते और प्रज्वलित करते हैं। पुनः शस्त्र-मंत्र से जली हुई कुशा अग्नि में डालते हैं, और फिर एक गूँथी हुई, एक विंग लंबी कुशा घास को घृत में रखते हैं। अब वे घृत में इड़ा आदि के लिए दो पंख और तीन शरीर की कल्पना करते हैं, और क्रम से तीन बार घृत लेकर अग्नि में आहुति देते हैं। इस प्रकार अग्नि में घृत की आहुति देते हुए शेष घृत क्रम से अर्पित करते हैं—‘ॐ हं अग्नये स्वाहा’, ‘ॐ हं सोमाय स्वाहा’, ‘ॐ हं अग्नि-सोमाभ्यां स्वाहा’—यह अग्नि के तीन नेत्रों के लिए नेत्रोन्मीलन की विधि है। चमचे में घृत भरकर चौथी आहुति देते हैं—‘ॐ हं अग्नये स्विष्टकृते स्वाहा’—और छह अंगों के ध्यान के साथ गौ-मुद्रा में जागरण करते हैं। घृत को त्रिविध शरीर से ढँककर, धनुष मुद्रा में उसकी रक्षा करते हैं, और हृदय से एक बूँद घृत डालकर छिड़काव और शुद्धि करते हैं। फिर वे मुखों का एकीकरण और स्पर्श की क्रिया करते हैं: ‘ॐ हं सद्योजाताय स्वाहा’, ‘ॐ हं वामदेवाय स्वाहा’, ‘ॐ हं अघोराय स्वाहा’, ‘ॐ तत्पुरुषाय स्वाहा’, ‘ॐ हं ईशानाय स्वाहा’,—हर घृत की आहुति के साथ मुखों का स्पर्श करते हैं। फिर मुखों का क्रमशः संयोग करते हैं: ‘ॐ हं सद्योजात-वामदेवाभ्यां स्वाहा’, ‘ॐ हं वामदेव-अघोराभ्यां स्वाहा’, ‘ॐ हं अघोर-तत्पुरुषाभ्यां स्वाहा’, ‘ॐ हं तत्पुरुष-ईशानाभ्यां स्वाहा’—इस प्रकार अग्नि से वायु तक, अंत में शिव तक, मुखों का संयोग करते हैं। अब चमचे से घृत की धार द्वारा मुखों का एकीकरण करते हैं—‘ॐ हं सद्योजात-वामदेव-अघोर-तत्पुरुष-ईशानाभ्यां स्वाहा’—इस प्रकार इच्छित मुख में सभी मुखों का समावेश होता है। फिर, ईशान के साथ अग्नि की पूजा कर, शस्त्र-मंत्र से तीन आहुति देते हैं, और पूर्ण भाव से उच्चारण करते हैं: ‘तुम शिव-अग्नि हो, हे हुताशन!’ जब अग्नि की हृदय में पूजा करके उसे मुक्त करते हैं, और दोनों पितरों का यथोचित सम्मान करते हैं, तब मूल और ‘वौषुड़’ के साथ संपूर्ण आहुति अर्पित करते हैं, जैसा शास्त्र में कहा गया है। अब हृदय के कमल में, सभी अंगों सहित, उसके गणों के साथ, तेजस्वी और श्रेष्ठ रूप में, पूर्ववत् पूजा कर, शिव से अपनी इच्छित कामना निवेदन करते हैं। अपने भीतर की नाड़ियों द्वारा यज्ञाग्नि और शिव का संबंध स्थापित कर, मूल और शस्त्र से हवन करते हैं, और अंगों के साथ दशांश आहुति देते हैं। घृत की आहुति कार्षिक माप से होती है, दूध और मधु की भी यही मात्रा है; दही के लिए शुक्ति माप, और खीर के लिए प्रसृति माप है। भोज्य पदार्थों के लिए मुट्ठी भर भुना चावल, कंद के लिए तीन टुकड़े, फलों के लिए उनकी उचित मात्रा, पके भोजन में आधा ग्रास, उत्तम पदार्थों के लिए पाँच आहुति, गन्ने के लिए अपरविका, लताओं के लिए दो अँगुल माप, फूल-पत्तों के लिए उनकी अपनी मात्रा, समिधा के लिए दस अँगुल की लंबाई; चंद्रिका, चंदन, कश्मीरी, कस्तूरी, यक्ष-राल के लिए उपयुक्त मात्रा; गुग्गुलु के लिए कलया के बराबर, बेर के बीज के समान, कंद के लिए आठवाँ भाग—यह श्रेष्ठ नियम है। अब ब्रह्म के बीज-मंत्रों के साथ हवन करें, और पूरा चमचा घृत नीचे मुख करके डालें। चमचे के अग्रभाग पर फूल रखकर, बाएँ हाथ से पकड़े, फिर दोनों को दाएँ हाथ से शंख-मुद्रा में पकड़ें। शरीर का आधा भाग उठाकर, दोनों चरण मिलाकर, फूल को नाभि पर रखें और चमचे का अग्रभाग नेत्रों की ओर करें। फिर ब्रह्म से आरंभ होने वाले कारण को त्यागकर, उसे सुषुम्ना से बाहर निकालें, और बाएँ वक्षस्थल में, उनकी जड़ों पर लाएँ। मूल मंत्र को अस्पष्ट रूप से, ‘वौषट्’ के साथ उच्चारित करें, फिर जौ के बराबर घृत अग्नि में अर्पित करें। इसके बाद जल का आचमन करें, चंदन, पान आदि अर्पित करें, और भक्ति से उसकी महिमा का सम्मान कर, परम प्रणाम करें। अब अग्नि की विधिपूर्वक ‘फट्’ शस्त्र-मंत्र से पूजा कर, सभी बंधनों को समेटें, और संहार-मुद्रा में ‘क्षमा करें’ कहें। तेजस्वी सीमाओं को, प्राण और सूक्ष्म हृदय के साथ, परम श्रद्धा से अपने हृदय के कमल में स्थापित करें। अब मुख्य पका हुआ भोजन लेकर दो मंडल तैयार करें; अग्नि वेदी के पास, भीतर और बाहर, बली अर्पित करें। पूर्व दिशा में ‘ॐ हां स्वाहा’ से रुद्रों को, दक्षिण में माताओं को, वरुण को ‘हां’, गणों को ‘स्वाहा’—यह बली उनके लिए है। उत्तर में यक्षों को ‘हां’, ईशान कोण में ग्रहों को ‘हां’, अग्नि में असुरों को ‘हां’, नैऋत्य में राक्षसों को बली दें। पश्चिम में क्षेत्रपाल को भीतर की बली, और दूसरे मंडल में, बाहर, इंद्र और अग्नियम को अर्पित करें। इस प्रकार, शास्त्रानुसार विधिपूर्वक यज्ञ की समस्त क्रियाएँ सम्पन्न होती हैं, और शिव की कृपा से साधक का उद्देश्य पूर्ण होता है।