आचार्य ने जब सभी आवश्यक वस्तुएँ यथास्थान स्थापित कर दीं, तब उन्होंने अपने हृदय में विशाल आवरण की स्थापना की। तत्पश्चात, वेद मंत्र से, उन्होंने उन तीनों तिनकों के छोरों पर शस्त्र मंत्र का उच्चारण किया। पाँच अग्नि-सामिधाएँ, जो घी में स्नान कराई गई थीं, तिनकों के छोर और मूल में अर्पित की गईं। मन में ब्रह्मा, शंकर, विष्णु और अनंत का पूजन किया गया। अब दूर्वा घास की पत्तियों से, क्रमशः, सीमारेखा की परिक्रमा की गई। हर निश्चित स्थान पर, इन्द्र आदि देवताओं से आरंभ कर, क्रमशः सभी स्थानों का पूजन किया गया। अग्नि की ओर मुख करके, मन से प्रत्येक दिशा में पूजन किया गया, ताकि विघ्न दूर हों और बालक की रक्षा हो। इसके बाद, शैव आदेश की घोषणा की गई। श्रुक और स्रुवा को ऊपर और नीचे मुख करके, क्रमशः ग्रहण किया गया। अग्नि में गर्म करके, कुशा घास की जड़, मध्य और अग्रभाग को स्पर्श किया गया। जहाँ कुशा से स्पर्श किया गया, वहाँ आत्मा का ध्यान ज्ञान और शिव रूप में किया गया। अब, हाँ, हीं, हूं और सं इन बीजाक्षरों के साथ, तीन तत्वों को क्रमशः स्थापित किया गया। शक्ति को श्रुचि में, शंभु को स्रुवा में, और हृदय के अणु के साथ प्रतिष्ठित किया गया। फिर, उनके गलों में तीन सूत्र पहनाए गए, पुष्प आदि से उनका पूजन किया गया, और उन्हें अपने दाहिने, कुशा घास के ऊपर रखा गया। अब, गौघृत को, जिसे दृष्टि और अन्य विधियों से शुद्ध किया गया था, लिया गया। अपने स्वरूप का ध्यान ब्रह्मरूप में किया गया, फिर उस घृत को ग्रहण किया गया। वेदी के ऊपर, अग्नि के क्षेत्र में, हृदय के केंद्र में घृत को घुमाया गया। फिर, विष्णु रूप का ध्यान करके, उस घृत को ईशान के क्षेत्र में रखा गया। कुशा घास की नोक से घृत को लेकर, ‘स्वाहा’ और शिरोमणि अणु के साथ आहुति दी गई। वह बूँद पहले विष्णु को, तत्पश्चात रुद्र रूप को समर्पित की गई। अपने ही स्वरूप का ध्यान करते हुए, उसे नाभि पर रोका गया, फिर तैराया गया। अंगुली भर लंबी कुशा से, अंगूठे और अनामिका की नोक से उसे स्पर्श किया गया। दोनों हाथों से पकड़े हुए, अग्नि की ओर मुख करके शस्त्र से तैराव की क्रिया की गई। इसी प्रकार, हृदय और आत्मा से भी तैराव किया गया। हृदय से जली हुई कुशा से, शस्त्र द्वारा उसे शुद्ध किया गया; फिर दूसरी प्रज्वलित कुशा से बुहारी और प्रज्वलित किया गया। शस्त्र मंत्र से कुशा को अग्नि में पुनः जलाया गया। फिर, गाँठ बाँधी हुई, अंगुली के आकार की कुशा लेकर, उसे घृत में डाला गया। घृत में दोनों पंखों और इड़ा आदि तीनों का ध्यान किया गया। क्रमशः, स्रुवा से तीन भाग घृत लेकर आहुति दी गई। इस प्रकार, अग्नि में एक भाग घृत की आहुति दी गई, फिर शेष घृत क्रमशः अर्पित किया गया। ‘ॐ हाँ, अग्नये स्वाहा; ॐ हाँ, सोमाय स्वाहा; ॐ हाँ, अग्निसोमाभ्यां स्वाहा।’ नेत्र उद्घाटन के लिए, अग्नि के तीन नेत्रों को आहुति दी गई। स्रुवा में घृत भरकर, चौथी आहुति दी गई—‘ॐ हाँ, अग्नये स्विष्टकृते स्वाहा।’ गाय के समान मुद्रा से, छह अंगों के साथ जागरण किया गया। घृत को तीन सूत्रों से ढँक दिया गया, बाण के अणु से उसकी रक्षा की गई। हृदय से घृत की बूँदें छिड़की गईं और शुद्धिकरण किया गया। मुखों का संयोग और एकीकरण किया गया—‘ॐ हाँ, सद्योजाताय स्वाहा; ॐ हाँ, वामदेवाय स्वाहा; ॐ हाँ, अघोराय स्वाहा; ॐ तत्पुरुषाय स्वाहा; ॐ हाँ, ईशानाय स्वाहा।’ प्रत्येक घृत आहुति के साथ मुखों का संयोग किया गया। फिर, ‘ॐ हाँ, सद्योजात-वामदेवाय स्वाहा। ॐ हाँ, वामदेव-अघोराय स्वाहा। ॐ हाँ, अघोर-तत्पुरुषाय स्वाहा। ॐ हाँ, तत्पुरुष-ईशानाय स्वाहा।’—इन मंत्रों से, क्रमशः अग्नि से वायु तक, फिर निर्ऋति और शिव तक, मुखों का ध्यान किया गया। सभी मुखों को एकत्र कर, स्रुवा में घृत भरकर आहुति दी गई—‘ॐ हाँ, सद्योजात-वामदेव-अघोर-तत्पुरुष-ईशानाय स्वाहा।’ इच्छित मुख में, सभी मुखों और उनके रूपों का समावेश किया गया। अग्नि का ईशान के साथ पूजन कर, अस्त्र मंत्र से तीन आहुति दी गईं। फिर, पूर्ण भाव से उच्चारण किया गया—‘तुम शिव हो, अग्नि हो, हवि के भोक्ता हो।’ हृदय में पूजन कर, अग्नि की स्थापना की गई, और पितरों को विधिपूर्वक, मूल मंत्र के ‘वौषट्’ से पूर्ण आहुति दी गई। इसके बाद, हृदय कमल में, सभी अंगों सहित, मंडल सहित, तेजस्वी और परम रूप में, पूर्ववत आवाहन और पूजन किया गया। अनुमति लेकर शिव को आहुति दी गई। यज्ञाग्नि और शिव के नाड़ियों को अपने भीतर जोड़कर, मूल मंत्र और उसके अंगों से दशांश आहुति दी गई। घृत की मात्रा एक कर्षा, दूध और मधु भी उतनी ही; दही एक शंख-भर, और खीर एक प्रसृति। सभी अन्न और धान्य की मात्रा एक मुष्टि; कंद और फल तीन-तीन, अपनी-अपनी मात्रा से। पकवान का आधा ग्रास, सूक्ष्म पदार्थों की पाँच आहुति; ईख का ऊपरी गाँठ, लता का दो अंगुली भर भाग। पुष्प और पत्ते अपनी मात्रा में, समिधा दस अंगुली की; कपूर, चंदन, केसर, कस्तूरी, लोहबान—ये सब कलाय के दाने जितने, गुग्गुलु बेर के बीज जितना, कंद का आठवाँ भाग अर्पित किया गया। इस प्रकार, ब्रह्म बीजाक्षरों से होम किया गया। फिर, स्रुवा को घृत से भरे पात्र में उल्टा रखा गया। स्रुवा के अग्रभाग पर पुष्प रखा, बाएँ हाथ में पकड़ा, फिर दोनों को दाएँ हाथ से शंख मुद्रा में पकड़ा। शरीर को आधा उठाकर, दोनों पैर मिलाकर सीधे खड़े हुए, उस मुद्रा को नाभि पर रखा, दृष्टि स्रुवा की नोक पर केंद्रित की। ब्रह्म आदि कारणों से मन को हटाकर, सुषुम्ना मार्ग से बाएँ वक्षस्थल तक लाया, वहाँ दोनों का मूल स्थापित किया। मूल मंत्र को अस्पष्ट उच्चारण के साथ, ‘वौषट्’ पर समाप्त किया गया। फिर, जौ के दाने जितना घृत अग्नि में अर्पित किया गया। फिर, जल का आचमन, चंदन, पान आदि अर्पित कर, श्रद्धा से उस महिमा का पूजन और परम नमस्कार किया गया। इसके बाद, अग्नि का अस्त्र मंत्र ‘फट्’ से पूजन कर, संहार मुद्रा से, ‘क्षमा करें’ कहा गया। उन तेजस्वी आवरण अग्नियों को, प्राण, हृदय और सूक्ष्म आत्मा के साथ, पूर्ण श्रद्धा से हृदय कमल में स्थापित किया गया। सभी श्रेष्ठ आहुतियों को लेकर, दो मंडल बनाकर, अग्निकुंड के भीतर और बाहर, अग्नि की उपस्थिति में आहुति दी गई। इस प्रकार, विधिपूर्वक, श्रद्धा और नियम से, यज्ञ की यह महान प्रक्रिया संपन्न की गई।